Linux软件安装

安装Miniconda

Miniconda相当于苹果手机的apple store，可以直接安装90%以上的软件。

安装步骤

• 查看服务器是多少位的 打开Xshell，输入uname -a，即可查看服务器位数
• 谷歌搜索miniconda 清华，根据自己服务器安装最新版本。
• 安装方式：（1）进入biosoft （昨天新建的目录），如果没有直接新建一个，mkdir biosoft；（2）进入biosoft目录，命令 cd biosoft；（3）wget 下载链接，如 wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh；（4）完成后安装，命令 bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh，根据程序显示按 enter or yes；（5）安装完成后激活，激活命令 source ~/.bashrc ，然后输入conda，激活成功后即可使用。

从Miniconda下载软件

• 添加镜像网站 复制粘贴以下代码，回车
  conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
  conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
  conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
  conda config --set show_channel_urls yes
• conda search fastqc 搜索fastqc软件
• conda install fastqc -y 安装fastqc软件
• conda remove fastqc -y 表示删除fastqc软件