Linux软件安装
安装Miniconda
Miniconda相当于苹果手机的apple store,可以直接安装90%以上的软件。
安装步骤
- 查看服务器是多少位的 打开Xshell,输入uname -a,即可查看服务器位数
- 谷歌搜索miniconda 清华,根据自己服务器安装最新版本。
- 安装方式:(1)进入biosoft (昨天新建的目录),如果没有直接新建一个,mkdir biosoft;(2)进入biosoft目录,命令 cd biosoft;(3)wget 下载链接,如 wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh;(4)完成后安装,命令 bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh,根据程序显示按 enter or yes;(5)安装完成后激活,激活命令 source ~/.bashrc ,然后输入conda,激活成功后即可使用。
从Miniconda下载软件
- 添加镜像网站 复制粘贴以下代码,回车
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes - conda search fastqc 搜索fastqc软件
- conda install fastqc -y 安装fastqc软件
- conda remove fastqc -y 表示删除fastqc软件