2018-09-26 用ggplot2标记时间序列线的末端

利用ggplot2的第二个Y轴(双坐标轴)标记折线图的末端。

原文见https://drsimonj.svbtle.com/label-line-ends-in-time-series-with-ggplot2

image.png

这是最终的效果图(注意线右面的数字!)

数据集

需要用到tidyverse 包中的 Orange 数据。这个数据集记录了5个橘子树随着时间再不同的环境中的生长数据。

library(tidyverse)

d <- Orange

head(d)
#> Grouped Data: circumference ~ age | Tree
#>   Tree  age circumference
#> 1    1  118            30
#> 2    1  484            58
#> 3    1  664            87
#> 4    1 1004           115
#> 5    1 1231           120
#> 6    1 1372           142

代码模板

绘制如上图的线段末端带有数字的图,代码应该长得像下满的样子😝:

# 你的数据集包括:
# - 分类列 GROUP colum
# - X列(比加时间)X colum (say time)
# - Y列 (你感兴趣的值)Y column (the values of interest)
DATA_SET

# 先提取出每个类别Y轴末端的向量的数值
DATA_SET_ENDS <- DATA_SET %>% 
  group_by(GROUP) %>% 
  top_n(1, X) %>% 
  pull(Y)

# 用 `sec.axis`绘图
ggplot(DATA_SET, aes(X, Y, color = GROUP)) +
    geom_line() +
    scale_x_continuous(expand = c(0, 0)) +
    scale_y_continuous(sec.axis = sec_axis(~ ., breaks = DATA_SET_ENDS))

让我们看看吧

让我们一点点绘图。我们已经有了数据分类列是 Tree, X值 是age, Y 值是circumference

首先当然是拿到每个类别最终点的数值:

d_ends <- d %>% 
  group_by(Tree) %>% 
  top_n(1, age) %>% 
  pull(circumference)

d_ends
#> [1] 145 203 140 214 177

然后建立基础图,没有标记数字,再逐层添加。

ggplot(d, aes(age, circumference, color = Tree)) +
      geom_line()

image.png

现在用 scale_y_*, 用参数 sec.axis 在右边创建第二个坐标轴, 需要展示的数值显示在 breaks,线段末端的数值决定的值:

ggplot(d, aes(age, circumference, color = Tree)) +
      geom_line() +
      scale_y_continuous(sec.axis = sec_axis(~ ., breaks = d_ends))

image.png

现在有点样子了。但是X轴左边还有些空隙,不美观啊。建议扩展一下X轴。用到的是 scale_x_*expand 参数:

ggplot(d, aes(age, circumference, color = Tree)) +
      geom_line() +
      scale_y_continuous(sec.axis = sec_axis(~ ., breaks = d_ends)) +
      scale_x_continuous(expand = c(0, 0))

image.png

进一步抛光打蜡

喜欢吗,这是进一步修饰图的代码:

library(tidyverse)

d <- Orange %>% 
  as_tibble()

d_ends <- d %>% 
  group_by(Tree) %>% 
  top_n(1, age) %>% 
  pull(circumference)

d %>% 
  ggplot(aes(age, circumference, color = Tree)) +
    geom_line(size = 2, alpha = .8) +
    theme_minimal() +
    scale_x_continuous(expand = c(0, 0)) +
    scale_y_continuous(sec.axis = sec_axis(~ ., breaks = d_ends)) +
    ggtitle("Orange trees getting bigger with age",
            subtitle = "Based on the Orange data set in R") +
    labs(x = "Days old", y = "Circumference (mm)", caption = "Plot by @drsimonj")

image.png
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