开端
序言
今天是开始学习生信的第3天,感觉越来越难了,但是也越来越能体会到代码的含义,融入其中。
学习内容
今天有一个重点内容-------Linux中软件的安装和卸载
安装
首先提到安装必须想到应用商城,那么Linux中的应用商城是啥呢?
那就是conda!所以我们需要线安装conda,然后才能安装你想要的软件。
1·安装镜像
百度/谷歌搜索“miniconda 清华”
输入命令 uname -a,查询服务器位数
复制你需要的连接
cd ~/biosoft
wget 刚才你复制的下载链接,如下图
2·安装miniconda
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh#按照他的指使操作
source ~/.bashrc#激活
conda#激活
#添加镜像
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes
3·安装和卸载软件
conda install fastqc -y#安装
conda install fastqc=0.11.7 -y #可以选择安装的版本
astqc --help #确认是否安装完成
conda remove fastqc -y#卸载软件
结语
ok,今天的学习就到这里啦!