1.应用于肿瘤耐药性关键基因的筛选
在文章TSC1 and DEPDC5 regulate HIV-1 latency through the mTOR signaling pathway 中，作者为探讨调控HIV病毒潜伏的关键基因，作者首先构建HIV的荧光报告细胞（HIV-1 proviral DNA+GFP），当HIV病毒复制的时候，GFP也同时表达，因此可以通过绿色荧光来观测HIV病毒的活动情况。
在HIV-GFP报告细胞中，转入sgRNA library进行大规模基因敲除，一定时间后用FACS分选出强绿色荧光表达细胞，经过4个循环后则得到了低荧光（HIV潜伏）和高荧光（HIV活动）两组细胞，通过NGS测序发现两组细胞中的sgRNA丰度情况，经过3次重复后得到257个基因对HIV病毒活动有正向作用，最后通过数据分析筛选出TOP的gene集。后续可针对TOP基因集进行针对性的验证。
我们还可以想象，把GFP细胞换成肿瘤药耐药细胞如厄洛替尼，将FACS分选换成给药+不给药两组，一定时间后检测两组细胞的sgRNA丰度差别，则可以找到厄洛替尼耐药相关的基因。
2.应用于VHL缺失肾癌细胞的联合致死基因的筛选
文章：VHL Synthetic Lethality Signatures Uncovered by Genotype-Specific CRISPR-Cas9 Screens
合成致死基因的筛选流程
1.构建细胞野生型和VHL缺失的细胞系，并进行RNA-Seq检测，通过富集分析验证构建细胞系没问题。
2.使用 genome-wide lentiviral library 进行筛选
