2018-10-06 往NCBI上面上传数据

如果你有测序的数据，在文章写完要发表的时候，杂志社可能会要求你把数据上传到公共的数据库，这个时候要学习一下如何上传数据到NCBI，其实网络上已经有详细的教程了，我还是记录一下，下次用的时候方便回忆。

1. 创建NCBI的账号
   记得邮箱要激活

2. 点击主页上的submit

   
   
   从submit 开始

3.先建立Bioproject
有一系列的值要填写，这个按照自己的样本填写

4. 再创建biosample
   一个bioproject 可以有多个biosample， 这个biosample 可以在创建bioproject 过程中全部创建好，也可以之后单独创建，到时候link 到同一个bioproject 即可

5. 创建SRA
   也是按照说明一步一步来，最后link到对应的biosample 和 bioproject中

其实总的来说就是bioproject - biosample-sra

这里面有几个要注意的

1. 不同的内容会有不同的excel表格要填写，填完之后上传会检测一下是否符合条件

两份excel

2. 上传最好使用aspera 数据量大的话使用命令行的aspera ，这样更加方便

3. 出现错误不要慌张，我完全按照流程上传了文件，但是系统检测出现error，我发邮件过去，NCBI那边会帮忙马上解决，服务很不错，有不懂或者更改的，都要发邮件过去咨询。