孝昌三年，萧宝寅被义军打得大败，退守长安。苏湛窥萧有拥兵自立的意图，因请病假在武功家乡休养。
萧宝寅受到朝廷猜疑，在走投元路的情况下，在长安自立为王，拥兵自守。同时派人去武功欲召苏湛为其参赞。
苏湛听到此讯，便对来人说：萧宝寅本是逃亡于魏，受到重用。今朝廷多事，岂能乘人之危而反目为仇。北魏朝廷虽然腐化，但“天命未改”，我不能跟着萧宝寅造反，以毁我苏家世代忠贞之名。拒绝了萧的要求。
后萧复派人劝说，苏湛更明确地指出了萧宝寅必然失败的结局，要求萧准许他退居家乡不出。萧宝寅素重苏湛的为人，深知他不会协助自己，便不再强求。
永安三年，萧宝寅兵败被杀，孝庄帝召苏湛回京城，拜为尚书郎。当庄帝问苏湛当年是如何劝说萧宝寅时，他说，我未能说服萧宝寅是有罪责的，但我效忠朝廷之志始终不易。孝庄帝很高兴，加授他为散骑侍郎。后来又升为中书侍郎。
孝武帝太昌元年，苏湛因病辞官返回家乡，后卒于家。追赠散骑常侍、镇西将军、雍州刺史。
