基因家族分析--需要分析什么

1、搜索基因家族成员蛋白保守结构域，鉴定基因家族成员；

2、预测基因家族成员的顺势作用元件；

3、构建系统进化发育树；

4、基因家族成员MOTIF分析及绘图；

5、基因结构图；

6、基因在染色体上的位置图；

7、MCScanX共线性分析，绘制基因组内基因家族成员共线性circos图；

8、计算串联重复基因的KA/KS；

9、选定的其他物种进行基因家族成员同源性分析；

10、结合转录组数据绘制该基因家族的表达量热图。