Linux--SRA runinfo 和accession list 的20题

1，如何下载SRA 的runinfo table 和accession list，PRJNA398328
提示：pubmed ，SRA 数据库

2，查看SRR_Acc_List.txt ，标记行号，单行显示；
提示：less，-NS
3，在SraRunTable.txt中 查找 RNA 并且统计行数
提示：grep ，wc
4，显示SRR_Acc_List.txt 前10行，并且结果存贮为 id
提示：head，>
5,将SraRunTable.txt 命名为info，将SRR_Acc_List.txt 命名为allid
提示：mv
6，查看allid 前10行，并且在info 中查询，id 的第一行、第二行、第三行信息；
提示：grep
7，查找 info中所用包含id 的信息；
提示：grep -f
8， 以上结果计算行数
提示：wc
9，对id进行编辑，插入＃开头的说明，第一行#accession id，第二行date：2018.05.20，插入SRR59338，退出，并保存；
提示：vi，i，esc，：，wq
10，在id 中搜索，SRR59338，并计数。在id中搜索SRR59338，并进行精确匹配
提示：grep，-c；-w
11，查找 grep 这个命令在哪里
提示：which grep
12，筛选出，不以#开头的行；
提示：grep -v，^
13, 找出info 中SRA_study 是哪一列，并提取那一列,显示前10行
提示：head（info），tr ‘\t’ ‘\n’, cat -n
14,找出 ，第一列，genotype 那一列，mouse_number 那一列，primary_tumor_index，SRA_Study
提示： cut，
15，mouse_number 那一列，提取出第一个分号前边的内容；
提示： cut -d‘;’
16, 抽提出 info 的第一列，并且排序，进一步去重，并统计每个去重的个数；
提示：cut ，sort，uniq，alias（后期用）
17，将上一步统计好的 按照重复次数的多少排序，多的在前，少的在后；另存为 tmp
提示：sort -k1，1 -r
18，找出 tmp 的第一列；
提示：awk ’{print}‘
20，上边的第一列相加
提示： paste -s -d + ，bc
21 取出第一列是WXS 的那些行；
提示：awk ，==

部分命令展示

新技能get：
cut |grep | sort | uniq -c