如何写一篇优秀的综述?Nature访问众多大咖给出的建议!

-----------前些日子因为要写综述,搞得焦头烂额,查阅了很多资料,看了很多经验贴。感觉这篇Nature杂志的官方访谈中给出的建议比较有代表性,虽然不涉及具体操作,大方向是有了。于是便自己整理翻译出来,供大家参考,有兴趣看原文的文末有网页链接。

CAREER FEATURE

04 December 202

Correction 09 December 2020

How to writea superb literature review

Naturespeaks to old hands and first timers about the workthey did to make their reviews sing.

正文

如何写出一篇优秀的文献综述?

《自然》杂志向老手和初来乍到的人讲述了他们为使自己的评论更具吸引力所做的工作。


引言:文献综述是科学家的重要资源。它们为一个领域提供了历史背景,同时对其未来轨迹提出了意见。创作它们可以为自己的研究和写作实践提供灵感。但是,很少有科学家受过如何撰写评论的培训,也很少有科学家受过什么是优秀评论的培训。甚至选择合适的软件来使用也可能是一个复杂的决策(请参阅“工具和技术”)。因此,《自然》杂志向那些引用率很高的评论的编辑和在职科学家们征求了他们的建议。


(1)新加坡南洋科技大学助理教授赵文婷给出的建议:1.聚焦并深挖研究领域内的一个点。2.避免在文中使用过多的行话。

她认为综述的写作让她在该领域有了更加深入的了解并对她后来的研究方向有着深远的影响。她在访谈中说到:“当我还是一名研究生时,评论写作提高了我对我所在领域发展历程的理解。我还了解到该领域尚未解决的挑战并在这个过程中引发了一些自己的想法。例如,当我作为博士生撰写第一篇评论时,我很沮丧,因为我们对细胞如何主动感知、与药物传递中使用的纳米颗粒相互作用和适应的了解太少。这一经历促使我研究如何改变纳米颗粒的表面性质以增强生物传感。当我转入博士后研究时,这个问题让我发现了细胞膜曲率的作用,这导致了我之后发表的文章和当前的研究重点。如果不写那篇评论,我就不会开始这方面的工作。”

此外她还指出,综述写作应该小而精,不应该贪大贪全。她谈到:“学生写第一篇评论的一个常见问题是过于雄心勃勃。当我写这篇文章时,我想象着对生物应用中使用的每一种纳米材料进行全面的总结。它最终成为了一项巨大的工作,讨论的论文太多,没有明确的分类方法。我们最终发表了这项工作,但决定将讨论范围严格限制在用于生物传感的纳米颗粒上,而不是涵盖不同的纳米材料在生物学中的应用。我给学生的建议是要接受文献综述不同于教科书这个概念:文献综述应该提供更集中的讨论,跳过一些主题也可以,这样你就不会分散读者的注意力。学生还应考虑编辑截止日期,尤其是受邀评论:确保评论的范围不要太广,以免耽误写作。好的复习还应该避免使用行话,并为该领域的新手解释基本概念。虽然我受过工程师培训,但我对生物学很感兴趣,我的研究是关于开发纳米材料在细胞膜上操纵蛋白质以及这如何影响衰老和癌症。作为“局外人”,我发现对这些生物学主题最有用的评论是那些以易于理解的科学语言与我交谈的评论。”


(2)伊利诺伊州芝加哥大学化学副教授田柏芝给出的建议:1.制定写作的过程。 2.形成自己的写作风格。

他谈到:“在我的实验室里,我们首先要问:这篇综述的目的是什么?我写这篇文章的原因包括有机会为科学界贡献见解,并确定我的研究机会。我还将评论写作视为培训早期职业研究人员项目管理和领导等软技能的一种方式。这对于主要作者来说尤其如此,因为他们将学会与合作者合作,将各个部分整合成一个平稳过渡、无重叠的作品。

在我们确定了一篇评论文章的必要性和目的后,我将从我实验室的研究人员中组建一个团队。我尝试将具有不同专业领域的学生包括在内,因为这有助于获得各种观点。例如,在《纳米神经接口图谱》这篇综述中,我们让具有生物物理学、神经工程、神经生物学和材料科学背景的作者专注于该综述的不同部分。

之后,我将与我的团队讨论大纲。我们进行了多次迭代,以确保我们充分扫描了文献,并且没有重复其他评论中出现的讨论。同样重要的是,提纲不是由我一个人决定的:学生们经常会有新的想法,他们可以把这些想法带到桌面上。完成后,我们继续写作。

我经常提醒我的学生把自己想象成“科学艺术家”,鼓励他们发展写作和展示信息的方式。添加更多的单词并不总是最好的方式:例如,我喜欢用表格来总结研究进展并建议未来的研究轨迹。我还考虑在我们的审查文件中加入简短视频,以突出工作的关键方面。我认为这可以增加读者群和可访问性,因为这些视频可以在社交媒体平台上轻松共享。”


(3)《自然评论物理学》的编辑安基塔·安尼尔班给出的建议:综述的时效性与图表的使用会让你的综述与众不同。

他指出:“作为期刊编辑,我的职责之一是评估评论建议。最好的建议是及时的,并且清楚地解释为什么读者应该关注建议的主题。

一篇评论仅仅是对文献中最新发展的总结是不够的:最有趣的评论反而提供了对该领域分歧的讨论。

科学家们通常以Figrs为中心讲述他们的主要研究论文,但在评论中,Figures往往起着次要作用。在我看来,审查Figures比大多数人认为的更重要。我最喜欢的一篇评论风格的文章展示了一个情节,将多篇研究论文的数据汇集在一起(其中许多论文直接相互矛盾)。然后用它来确定广泛的趋势,并提出可以解释所有不同结论的潜在机制。

评论文章的一个重要作用是向研究人员介绍一个领域。为此,Figures可以很好地说明正在讨论的科学,就像演讲的第一张幻灯片一样。这就是为什么在《自然评论》上,我们有内部插画师来帮助作者。然而,简单是关键,即使没有专业插画师的支持,研究人员仍然可以使用许多免费的绘图工具来提高他们的审查Figures的价值。”


(4)大田韩国高级科学技术研究所研究助理教授崔耀金给出的建议:要保持更新你的文献并广泛地接受建议。

他谈到:2018年,我作为博士生开始撰写评论《利用微生物细胞和噬菌体生物合成无机纳米材料》。我花了一年的时间写初稿,因为我在博士研究的同时也在写这篇评论,而且大部分是我自己写的,还有我顾问的支持。又花了一年时间完成同行审查、修订和出版过程。在此期间,发表了许多新论文,甚至发表了相互竞争的评论。为了提供最新和最具原创性的评论,我必须与文献保持同步。在我的例子中,我使用了Google Scholar,我将根据关键字每天向我发送相关文献的更新。

通过我的评论写作过程,我也学会了更开放地接受批评,以提高我作品的价值和读者群。起初,我的综述只关注于利用微生物细胞(如细菌)来生产纳米材料,这是我博士研究的主题。像这样的细菌被称为生物工厂:即生产生物材料的有机体,这些生物材料可以被修饰以生产有用的材料,例如用于药物输送目的的磁性纳米颗粒。

然而,当第一份同行评审报告出来时,三位评审员都建议将评审范围扩大到另一种生物工厂:噬菌体。这些基本上是感染细菌的病毒,它们也可以产生纳米材料。这些反馈最终让我讨论了各种生物工厂之间的差异(噬菌体、细菌、真菌和微藻)及其优缺点。这是一个很好的补充,因为它使审查更加全面。写这篇评论也让我想到了一个想法,那就是利用纳米材料修饰的微生物来生产化学品,我现在还在研究。


(5)英国剑桥大学博士生PAULA MARTIN-GONZALEZ给出的建议 :充分利用技术和工具。

他介绍到:就在冠状病毒爆发之前,我的博士老板和我决定写一篇文献综述,讨论医学成像与基因组学的结合,以改善卵巢癌的管理。

当我研究这篇评论时,我注意到一种趋势,即一些论文不断被该领域的许多其他论文引用。我很清楚,这些论文一定很重要,但作为综合癌症生物学领域的新成员,很难立即找到并阅读所有这些“开创性论文”。

当时我决定编写一个小应用程序,以提高我的文献研究效率。使用我的代码,用户可以输入一个查询,例如“卵巢癌、计算机断层扫描、影像组学”,应用程序将搜索在数据库(如PubMed)中存档的所有相关文献,其中包含这些关键词。

然后,代码识别相关论文,并创建搜索结果中引用的所有参考文献的引用图。该软件突出显示了与搜索中的其他论文有许多引用关系的论文,因此可以称为开创性论文。

我的代码极大地改进了我组织论文的方式,并向我通报了我研究领域的主要出版物和发现:否则,这将需要更多的时间和经验。在GitHub上分享了我的代码后,我收到的反馈是,对于不习惯编码的研究人员来说,这可能会让人望而生畏。因此,我希望以网页的形式构建一个更为用户友好的界面,类似于PubMed或Google Scholar,用户只需输入查询即可生成引用图。

小编对于工具的使用:市场上的大多数文献管理软件在提供Microsoft Word插件和生成不同的引用样式时都提供类似的功能。但根据你的工作偏好,有些可能比其他更合适。这里受访者推荐了一些文献管理软件,具体的功能大家可以自己查询:Attribute, EndNote, Mendeley, Zotero, Paperpile.这里还介绍了一些写作的工具,最常用的就是我们的Word,小编之前想学习Markdown,但是后来发现Markdown对自己的用处并不大,就像在这次访谈中有学者提到的那样:“*Markdown和LaTex是物理学家、数学家和计算机科学家喜欢的基于代码的格式化语言,他们经常进行编码,但在生物学和化学等其他学科中不太受欢迎”。Markdown最大的好处可能就是插入代码和公式比较方便,其他的对我们搞生物的用处不大。


原文链接:https://www.nature.com/articles/d41586-020-03422-x

王山山 2022年5月28日完成

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