一,R版本升级
之前用的R版本是3.5.3,一切运行顺畅。
五一前就很想安装maftools包,但是反复尝试就是安装不成功,不知道原因出在哪里了
点开主页:类似于markdown格式的
maftools : Summarize, Analyze and Visualize MAF Files
昨天也就是五月四号,再次尝试,实际上这个包的介绍其实也是刚刚的事情
再一看,bioconduct上的安装要求,要求是R版本是3.6的(这个细节不容易发现吧)
接下来就是升级R版本到3.6,然后就顺利安装了maftools。PS:如果不知道怎么升级R版本,就去baidu
二,重装老R包
R版本是升级了,但是发现原来的R包用不了了,那就重新安装一遍,速度飞快,问题解决。
常规的R包安装没毛病,但是一下有个性的R包更新没有即使,对于刚升级的R不兼容,举例
ESTIMATE包ESTIMATE: Home
2016年9月更新过一次,最新版本是1.0.13。注意这个包的的地址
本来一开始,我要设置安装版本的
install_version(c('estimate'), c('1.0.13'),repos=rforge,type="source")
后来我发现,不需要制定版本号,直接安装
rm(list = ls())
options()$repos
options()$BioC_mirror
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
options()$repos
options()$BioC_mirror
library(utils)
rforge <- "http://r-forge.r-project.org"
install.packages("estimate", repos=rforge, dependencies=TRUE)
the end。
补充一下,安装R包,一定要在网速最好的时候。另外,多去搜狗微信搜索,绝大部分 能解决你的问题,因为你现在遇到的问题别人可能早已遇见过了。
以上,第一次分享,感觉分享的不好。因为是问题解决了,才想起来分享,过程中的一些细节还是没有展示出来。遗憾。