不同基因组版本切换

👇 安装CrossMap

pip install CrossMap

CrossMap

CrossMap 0.6.0 documentation

👇 下载liftOver文件
Index of /goldenPath/hg19/liftOver (ucsc.edu)

wget -c http://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath/hg19/liftOver/hg19ToHg38.over.chain.gz
gunzip hg19ToHg38.over.chain.gz

👇 转换bw文件

CrossMap bigwig ../reference/hg19ToHg38.over.chain GSM2359978_Control_0hr.bw output.bw

👇UCSC的liftover软件推荐的人也挺多

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