基本操作
## 读取文件
import scanpy as sc
adata = sc.read("/path/00.datasets/HLCA/local.h5ad")
## 查看meta信息
adata.obs.head(5)
## umap图
sc.pl.umap(adata, color='scanvi_label')
## 提取数据
adata_copy = query_data[query_data.obs['new_tcell_num'] == 1]
scanpy相关操作
最后编辑于 ：
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
- 文/潘晓璐 我一进店门，熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来，“玉大人，你说我怎么就摊上这事。” “怎么了？”我有些...
- 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着，像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上，一...
- 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼，长吁一口气：“原来是场噩梦啊……” “哼！你这毒妇竟也来了？” 一声冷哼从身侧响起，我...
推荐阅读更多精彩内容
- 前言 学习 Maching Learning，怎么能少得了服务器呢，本来想现在自己小菜鸟一枚，就自己在本地用 CP...
- 接上一章节RabbitMQ(一)之工作模式、生产者消息确认机制[https://www.jianshu.com/p...
- 关注wx：CodingTechWork，一起学习进步。 引言 对zk的学习和简单实用进行一个总结。 zk介绍 ...
