生态系统多样性（Ecosystem diversity）是指生物圈内生境、生物群落和生态系统的多样性以及生态系统内生境差异、生态过程变化的多样性。生态系统多样性主要涉及较大单元的生态系统，如：森林生态系统、草原生态系统、湖泊生态系统、湿地生态系统等。
生态系统多样性是物种多样性的保证。任何生物都要生活在一定的环境中，离开了适宜的环境，生物很难适应。所以只有多种多样的生态系统，才能保证这些生态系统中多种多样的生物的生存，从这个意义上来说，保护生物多样性是重要的一点就是保护生态系统的多样性，生态系统多样性是物种多样性的保证。生物与生物间（同种或不同种）、生物与无机环境间的共同进化形成生物多样性（包括物种多样性、基因或遗传多样性和生态系统多样性）。
由于人类活动和自然灾害的干扰，世界上不少地区生态系统遭到严重破坏，植被消失，土壤蚀化，生态系统多样性严重受损。对恢复受害生态系统的生态学研究受到世界各国的普遍重视。
生态系统多样性的研究具有十分重要的意义。一方面，生态系统类型多样，其组成、结构、分布和动态等特征极富变化；另一方面，生态系统多样性的研究又为其他水平的生物多样性的研究提供有用的资料，特别是作为生物的栖息地受到保护生物学工作者的高度重视。
生态系统多样性
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