R的数据结构
- R的赋值符号是<- ，快捷键为：alt+减号
- 在Console 控制台（左下方区域）输入命令，相当于Linux的命令行
- 显示工作路径 getwd()，设置工作路径setwd()
- 向量是由元素组成的，元素可以是数字或者字符串
- 表格在R语言中改名叫数据框
- R的代码都是带括号的，括号必须是英文的
- 函数或者命令不会用时，用命令：？xx函数，看example解释
- 数据类型5种
-向量（vector）👈重要
-矩阵（Matrix）
-数组（Array）
-数据框（Data frame）👈重要
-List
一、向量
元素：数字或者字符串（用chr表示）等，分为标量和向量
标量：一个元素组成的变量
向量：多个元素组成的变量
- 如何给向量赋值：
x<- c(1,2,3) #常用的向量写法，意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量。
x<- 1:10 #从1-10之间所有的整数
x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数（注意是逗号不是分号）
x<- rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次
- 从向量中提取元素（根据元素位置）
#这里的x是你刚才赋值的变量名，根据自己的情况来修改
x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素
- 从向量中提取元素（根据值）
x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素
二、数据框
- 读取本地数据
setwd("~/Desktop/Bioinformatics")
read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header = T)
a <- read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header = T)
- 设置行名和列名
x<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量x是一个数据框
colnames(x) #查看列名
rownames(x) #查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...
colnames(x)[1]<-"bioplanet"#有的公式返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改
x<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名
- 数据框的导出
write.table(x,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号）
- 变量的保存与重新加载
#这次没有处理完的数据下次想接着用，学会保存和重新加载。保存的格式是RData。
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(x,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令
- 提取元素
a[x,y]#第x行第y列
- a[x,]#第x行
- a[,y]#第y列
- a[y] #也是第y列
- a[a:b]#第a列到第b列
- a[c(a,b)]#第a列和第b列
- a$列名#也可以提取列（优秀写法，而且这个命令还优秀到不用写括号的地步，并且支持Tab自动补全哦，不过只能提取一列）
- 直接使用数据框中的变量
iris是R语言的内置数据，可以直接使用。提取某两列作散点图：
plot(iris$Sepal.Length,iris$Sepal.Width)
Rplot iris
Q&A
Q：save(X,file="test.RData")这句代码如果报错object X not found，是为什么，应该怎么解决？
A：X改为小写x，注意区分大小写、中英文标点符号！
