服务器安装不上cellchat问题,
devtools::install_github("sqjin/CellChat")
显示缺失ggpubr包,安装这个包又会缺失nloptr
所以这里根据之前平台的建议,模仿就是自己再终端下载这个包,然后再安装ggpubr包
终端输入
wget https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/nloptr/nloptr_1.2.2.tar.gz
这里我试了选择高版本,但是还是不行,可能不支持R4.1吧,最后挑了一个低版本,没想到就可以了
R CMD INSTALL nloptr_1.2.2.tar.gz
这个包就装好了,然后回到R再正常安装ggpubr,再安装cellchat就可以了!!