自20世纪90年代以来，间充质干细胞疗法逐渐被用于难治性自身免疫性疾病的干预。由于间充质干细胞具有多向分化潜能、免疫调节、造血支持以及低免疫原性、无免疫排斥等特点，近年来其已在难治性和重症自身免疫性疾病的干预中得到应用，为患者提供了新选择。
近年来，干细胞疗法已成为治疗糖尿病、心脑血管疾病、神经系统疾病、自身免疫病等疾病的一种很有前途的方法[1][2]。
1、系统性红斑狼疮 ：
系统性红斑狼疮是一种异质性、多系统疾病，目前主要采用皮质类固醇和免疫抑制剂治疗[3]。然而，现有标准疗法具有严重的副作用，包括卵巢功能衰竭和继发性恶性肿瘤等等[4]。因此，临床上需要更有效且副作用更少的替代治疗方案来改善患者预后。一些研究显示，间充质干细胞可分泌多种免疫调节因子，帮助恢复免疫平衡，有望治疗这些疾病[5]。
同时，几乎所有的临床试验都表明，间充质干细胞移植对于系统性红斑狼疮谱系中的多种疾病治疗康复都是有效的[6]。Sun等人成功治疗了一些每月静脉注射环磷酰胺和口服强的松无效的系统性红斑狼疮患者(≥20毫克/天）[6][7]。所有患者在1、6和12个月的随访中都有显著改善，临床症状、尿蛋白和免疫细胞功能都显示了这一点。
此外，Wang等人的研究显示了脐带间充质干细胞输注治疗系统性红斑狼疮患者的长期安全性。其结果证实，在6年的观察中，干细胞治疗是安全的，并且没有与治疗相关的肿瘤不良事件发生[8]。
但由于其研究人群数量较少，因此对于异体干细胞治疗系统性红斑狼疮的安全性，需要更大规模研究来评估。
2、多发性硬化：
多发性硬化是一种中枢神经系统白质脱髓鞘性自身免疫性疾病，由T细胞对中枢神经系统髓鞘成分的自身免疫反应引起[9]。随着病情发展，不可避免地导致运动功能丧失、敏感障碍和认知障碍[4][10]。传统的疗法不能有效控制疾病发展，通常作为二线疗法使用的免疫抑制疗法也只有部分效果，而间充质干细胞具有免疫调节和神经营养作用[10]。
Petrou 等人评估骨髓间充质干细胞移植治疗活动性和进行性多发性硬化症患者的最佳给药方式、安全性和临床疗[11]。48名进行性多发性硬化症患者被纳入研究。
研究期间，除发生了三起与细胞治疗无关的严重不良事件外，在14个月的试验期间，未观察到其他严重不良事件[10]。通过对多发性硬化患者的研究发现，自体干细胞可以改善患者的预后，鞘内注射优于静脉注射[10][11]。
3、类风湿性关节炎：
类风湿关节炎是一种T细胞介导的系统性自身免疫性疾病，以滑膜炎症和关节损伤为特征，严重时可导致关节变形甚至残疾。类风湿关节炎给患者生活带来的不便往往给患者带来严重的精神压力。目前类风湿关节炎的治疗主要依靠相关药物和物理疗法来缓解症状，但费用昂贵，不良反应明显[12]。
在Liu等人研究中，脐带间充质干细胞抑制了T细胞的各种炎症作[13]。其结果表明，脐带间充质干细胞在类风湿性关节炎治疗中具有广阔的应用前景[14]。Sonomoto等人的研究结果显示，间充质干细胞是类风湿性关节炎患者一种强有力的治疗工具，可以同时抑制炎症和骨再生[15]。
4、I型糖尿病：
I型糖尿病是年轻患者中最常见的慢性自身免疫性疾病，其特征是胰岛β细胞丧失，临床表现为胰岛素缺乏，同时具有高血糖[16]。目前，糖尿病尚无确切的治疗方法。胰岛素注射不能模拟细胞对葡萄糖稳态的精准调控，从而导致并发症的长期发生。因此，寻找其它治疗方式是必要的。
目前，细胞治疗被认为是一种具有一定可行性的方法[17]。间充质干细胞不仅可以完成对受损β细胞的替换，还可以诱导内源性β细胞的再生[18]。Li等人的研究显示在胰腺内移植间充质干细胞可以改善胰腺损伤引起的低胰岛素血症和高血糖症。在受损胰腺中，间充质干细胞通过迁移、分化并改善胰腺微环境。重要的是，干细胞可触发内源性胰腺干/前体细胞的自我修复，导致胰岛再生【13】。
虽然间充质干细胞对自身免疫病的疗效确切，但距离真正广泛地、安全地投入到自身免疫病的治疗还有很长一段路要走。可以预想，随着研究的深入，一种新的、安全的间充质干细胞治疗方法最终会出现，并彻底改变自身免疫病患者的治疗方式[19]。
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