向量（vector）
向量是由元素组成的，元素可以是数字或者字符串。
1.标量与向量
元素：数字或者字符串（用chr表示）
标量：一个元素组成的变量
向量：多个元素组成的变量
字符串要加
“chr ”
赋值
x<- c(1,2,3) #常用的向量写法，意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量。
x<- 1:10 #从1-10之间所有的整数
x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数（注意是逗号不是分号）
x<- rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次
2.从向量中提取元素
- 根据元素位置
#这里的x是你刚才赋值的变量名，根据自己的情况来修改
x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素
- 根据值
x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素
数据框
表格在R语言中改名叫数据框_
header
header=T则文档第一行为列表名称
header=F则文档第一行就是数据
seq
seq(from = 1, to = 1, by = ((to - from)/(length.out - 1)),
length.out = NULL, along.with = NULL, ...)
seq.int(from, to, by, length.out, along.with, ...)
seq_along(along.with)
seq_len(length.out)
from：生成向量的起点。
to：生成向量的终点。
by：序列的增量，默认步长为1（可修改）。
> seq(10) # same as 1:10, or even better seq_len(10)
[1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
> seq(0, 10, by = 2 ) # ' by = '可省略
[1] 0 2 4 6 8 10
length.out：这个序列的输出长度。
对于seq和seq.int来说，如果分数的话，将会被四舍五入。
> seq(1, 10, length.out = 6) # "length.out"= "len"
[1] 1.0 2.8 4.6 6.4 8.2 10.0
读取文件
read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header = T)
\t :横向制表(HT) (跳到下一个TAB位置)
设置列名、行名
X<-read.csv('doudou.txt')
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#设置第一列名为“bioplanet”
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名
数据框的导出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号）
sep 分隔 ； quote 双引号
1.png
变量的保存与重新加载
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令
提取元素
- X[x,y]#第x行第y列
- X[x,]#第x行
- X[,y]#第y列
- X[y] #也是第y列
- X[a:b]#第a列到第b列
- X[c(a,b)]#第a列和第b列
- X$列名#也可以提取列（只能提取一列）
直接使用数据框中的变量
a <-data.frame(case=paste("S",1:50),values=runif(50))
> plot(a$case,a$values)
1.png
问题
save(X,file="test.RData")这句代码如果报错X not found，是为什么，应该怎么解决？
没找到应该是变量没载入，load或赋值.
