【现学现卖】绿色荧光蛋白2-结合免疫印迹法探究真菌病毒在菌落的分布和蔓延

A novelcolony-print immunoassay reveals differential patterns of distribution andhorizontal transmission of four unrelated mycoviruses in Rosellinia necatrix(Yaegashi etal., 2011)一种新的菌落免疫印迹分析方法揭示了葡萄白纹羽病原菌中四种真菌病毒的分布和水平传播模式

摘要

一种菌落免疫印迹技术(colony-print immunoassay,CPIA)利用anti-dsRNA抗体研究四种白纹羽病菌中的病毒partitivirus (RnPV1),mycoreovirus(RnMyRV3),megabirnavirus(RnMBV1),和unidentifiedvirus(RnQV1)在寄主中的分布和水平传播。结果发现RnPV1和RnMBV1均匀分布在单个菌落中,而RnMyRV3在某些菌落扇区中不存在,RnQV1则在扇区之间表现出不同的积累水平。它们在真菌菌丝间的传播速度有差异,并且一种病毒的传播速度会受到菌落中其他现存病毒的影响。真菌-病毒,病毒-病毒之间可能存在多种互作模式。

材料方法

真菌:不含病毒的白纹羽病菌R. necatrix W97菌株+潮霉素抗性基因→RT45-1菌株(不含病毒,抗潮霉素,代号rVF);W97菌株+plasmid pCPXHYeGFP(可以表达GFP和潮霉素抗性)→RT57-1菌株(不含病毒,抗潮霉素,表达GFP,代号pVF)。并通过菌丝融合的方式让4种病毒分别侵染真菌,并在潮霉素平板筛选,得到系列菌株,如表1。收集菌丝,提取dsRNA,凝胶电泳。

斑点免疫印迹:采用J2单克隆抗体(J2 monoclonal antibody),它是一种抗双链RNA抗体(anti-dsRNA antibody)。这个实验以真菌粗提物,总核苷酸和dsRNA为对象,进行免疫印迹实验,发现三种材料产生的印迹强度没有明显差别,抗体的效率一样。说明在菌落免疫印迹里使用J2单克隆抗体具有可行性。

菌落免疫印迹(CPIA):文章提到了两个实验,分别用的是针对绿色荧光蛋白的抗体(anti-GFP antibody)和J2单克隆抗体。GFP抗体对rVF和pVF菌株菌落做了印迹实验,发现对比明显,CPIA可行。而用J2单克隆抗体做的就是本文的目的实验,检测病毒的分布和水平传播。

结果

预实验都是成功的:首先材料准备,通过菌丝融合的方法产生了系列真菌菌株都成功转入了报告基因或者病毒。预实验1,GFP抗体对于rVF,pVF菌株菌落的CPIA实验有对比明显的印迹结果,说明CPIA实验可行。预实验2,J2单克隆抗体的效率稳定,不论对象是dsRNA,还是粗提物,可以用于CPIA实验种探测病毒。

病毒在菌落中的分布实验,J2抗体针对系列菌株的CPIA实验表明病毒的分布特点不同,见图1。

病毒水平传播实验,通过有毒有荧光的供体和无毒无荧光的受体菌落共培养,传毒,检测病毒在受体菌落中的传播,见图2(以一种病毒RnPV1为例)。

图1. 荧光场显示了菌落轮廓;第二排CPIA的深色部分表示的是dsRNA(病毒)的分布;而第三排也是CPIA实验,所用探针是针对GFP基因的。

图2. 明场照片显示了供体受体菌落轮廓,测量受体菌落半径,拍照时间以受体菌落半径为主。荧光场显示的是供体菌落轮廓,这主要是为了在CPIA实验里划分供体和受体区域。在CPIA照片中,红色和绿色虚线之间表示受体中的病毒。

参考文献

Yaegashi, H., Sawahata, T., Ito,T., and Kanematsu, S. (2011) A novel colony-print immunoassay reveals differentialpatterns of distribution and horizontal transmission of four unrelatedmycoviruses in Rosellinia necatrix. Virology409: 280-289.

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 216,324评论 6 498
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 92,356评论 3 392
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 162,328评论 0 353
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 58,147评论 1 292
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 67,160评论 6 388
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 51,115评论 1 296
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 40,025评论 3 417
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 38,867评论 0 274
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 45,307评论 1 310
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 37,528评论 2 332
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 39,688评论 1 348
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 35,409评论 5 343
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 41,001评论 3 325
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 31,657评论 0 22
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 32,811评论 1 268
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 47,685评论 2 368
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 44,573评论 2 353