mitos2_安装以及使用2020-11-25

https://libraries.io/pypi/mitos
https://gitlab.com/Bernt/MITOS

mitos2的网址
pip install mitos


图片.png

报了一堆错，看不懂没关系，试一下conda看看是什么问题？

conda install mitos -c bioconda -m -n mitos

。。。。。
其实好奇怪我记得之前用conda好像不行，但是最近用conda一下子就装上了

runmitos.py -i sequence.fas  -c 5 -r refseq63m --refdir /apps/MItos-refdata -o SPHDmitos

--refdir /apps/MItos-refdata放置refseq的目录
-r refseq63m选用哪个文件夹选用哪个库
Reference data for MITOS2
https://zenodo.org/record/2672835#.X73OjLepQdU

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