早上好啊(虽然是中午了),这里是佳奥,因为我的新iPad pro到了需要同步,今天开始的比较晚,也不是因为看到了异度之刃3的新宣传。好了那么我们接着上一篇的内容继续往下吧!
3 数据的输入
我们要学习的是如何从外部输入数据到R中。
R可以导入统计软件、键盘、文本文件和数据库管理系统等数据。
3.1 使用键盘输入数据
具体的步骤是:
1、创建空矩阵,其中变量名和变量模式与最终数据集合一致。
2、针对这个数据对象调用文本编辑器,输入数据,并将结果保存回此数据对象中。具体如下:
编辑的结果需要回到赋值对象本身。函数edit( )是在对象的一个副本上操作的,如果没赋值到一个目标,修改是保存不了的。
我们还可以用编辑器修改变量名称和变量类型,还可以单击未使用的列标题来添加新的变量。
编辑器关闭后,结果会保存在之前赋值的对象中。本例子是mydata。再次调用mydata <- edit(mydata)可以查看并进一步编辑。
其中:
3.2 从带分隔符的文本文件导入数据
当然,谁也不想用手敲大量数据,那么其他方法呢?
使用read.table( )从带分隔符号的文本文件中导入数据。此函数可以读入一个表格格式文件并将其保存为一个数据框。具体如下:
其中,
file:带分隔符的ASCII文本文件。
header:表明首行是否包含了变量名的逻辑值(TRUE或FALSE)。
sep:指定分隔数据的分隔符。
row.names:一个可选参数,用以指定一个或多个表示行标识符的变量。
举个具体例子吧:
当前工作目录读取一个名为studentgrades.csv的逗号分隔文件,从文件第一行取得各变量名称,将变量STUDENT指定为行标识符,最后将结果保存到名为grades的数据框中。
默认情况下,字符型变量将转化为因子,但我们不是总希望这么做。可以设置选项:
这将停止所有字符型变量的转换。另一种方法是使用选项colClasses为每一列指定一个类,例如logical逻辑型、numeric数值型、character字符型和factor因子。
补充:
函数url( )能够让你通过一个含有http://、ftp://或file://的完整URL访问网络上的文件,还可以为HTTP和FTP连接指定代理。更多详见help(file)。
3.3 导入Excel数据
读取Excel最好的方式是在Excel中将文件导出为逗号分隔文件.csv,并使用前文描述将其导入R。在Windows系统可以使用RODBC包来直接访问Excel文件。电子表格的第一行应包含变量/列的名称。具体如下:
这里的myfile.xls是一个Excel文件,mysheet是要从这个工作簿中读取工作表的名称。
channel是一个由odbcConnectExcel( )返回的RODBC连接对象,mydataframe是返回的数据框。
当然,RODBC也可用于从Microsoft Access导入数据。
在更新版本的Excel采用了.xlsx格式,所以采用xlsx包可以来读取这种格式的表格。安装好包后,包中函数read.xlsx( )可以将.xlsx文件中工作表导入一个数据框。最简单的调用格式是:read.xlsx(file, n)。其中file是Excel的工作簿所在路径,n为要导入的工作表序号。在Windows上的举例:
从位于D盘根目录的工作簿myworkbook.xlsx中导入了第一个工作表,并将其保存为一个数据框mydataframe。
xlsx包不仅仅可以导入数据表,它还能够创建和操作.xlsx文件等。
3.4 导入XML数据
下包吧。由Duncan Temple Lang编写的XML包允许用户读取、写入和操作XML文件。
3.5 从网页抓取
一种途径是使用函数readLines( )下载网页,然后使用如grep( )和gsub( )一类的函数处理它。
对于结构复杂的网页,可以使用RCurl包和XML包来提取其中想要的信息。
3.6 导入SPSS数据
不想导入(X)
通过foreign包中的函数read.spss( )导入到R中。
也可以使用Hmisc包中的spss.get( )函数。
函数spss.get( )是对read. spss() 的一个封装,它可以为你自动设置后者的许多参数,让整个转换过程更加简单一致。
mydata.sav:要导入的SPSS数据文件。
use.value.labels=TRUE:表示让函数将带有值标签的变量导入为R中水平对应相同的因子。
mydataframe:导入后的R数据框。
3.7 导入SAS数据
foreign包中的read.ssd( )和Hmisc包中的sas.get( )可以,但较新版本的SAS并不适用,可以将SAS中使用PROC EXPORT将SAS数据集保存为一个逗号分隔的文本文件,并按照该文件类型导入到R中。
3.8 导入Stata数据
直接上代码:
这里面的mydata.dta是Stata数据集,mydataframe是返回的R数据框。
3.9 访问数据库管理系统
在R中通过RODBC包访问一个数据库。这种方式允许R连接到任意一种拥有ODBC驱动的数据库。
具体函数待用到再详细展开。
4 数据集的标注
为了使结果更易于解读。通常标注包括为变量名称添加描述性标签,以及为类别型变量中的编码添加值标签:
变量age:附加一个更详细的标签“Age at hospitalization (in years)”即入院年龄。
变量gender:对于编码为1或2,关联标签"male"和"female"上。
4.1 变量标签
R处理变量标签的能力有限,那么就直接将变量标签作为变量名吧。(听君一席话)
比如把之前包含age的数据框:
很明显,新的变量名太长,不适合重复输入。(............)
如果能尝试想出更好的命名(例如,admission Age)可能会更好一点。(.........)
4.2 值标签
这个就有用多了,函数factor( )可以为类别型变量创建值标签。假设有一个名为gender变量,1表示男性,2表示女性,可以使用代码:
levels代表变量的实际值,而labels表示包含了理想值标签的字符型向量。
5 处理数据对象的实用函数
书上补充:
函数head( )和tail( )对于快速浏览大数据集的结构非常有用。
例如,head(patientdata)将列出数据框的前六行,而tail(patientdata)将列出最后六行。
6 小结
终于结束了数据准备的部分。
数据的准备 可以说是数据分析中最具挑战性的任务之一。
掌握通过括号表达式选取元素的能力,对数据的选择、取子集和变换将是非常重要的。
那么以上就是数据准备的内容,下一篇我们将注意力集中于R的绘图上,以及如何创作图形,我们下一篇再见!