扁桃体肿大应尽量早治疗。在病情初期，刚开始见上述症状时，应该尽快到有关医院检查。扁桃体肿大的治疗患者很多都因为不了解扁桃体肿大，所以症状发现初期，并没有及时进行扁桃体肿大的治疗，使得扁桃体肿大病情扩大。
下述情况有必要切除扁桃体：频繁发作的扁桃体炎，或者扁桃体病变全面影响儿童健康或使儿童中断学业，以及影响听力或呼吸时。然而，有时施行扁桃体切除术是不必要的，如果诊断有怀疑就要考虑是不是其他问题。
扁桃体切除术适应征包括：扁桃体炎一年发作四次或四次以上；扁桃体炎两年内每年发作三次或三次以上；扁桃体肿大引起的上呼吸道阻塞，造成严重打鼾，吞咽不畅，发音不清等；有过一次或一次以上扁桃体脓肿；扁桃体引起了全身疾病，成为病灶性扁桃体；扁桃体反复发炎引起鼻炎、中耳炎、气管炎等反复发作或久治不愈。
手术在全麻下进行，当患者进入深睡眠状态并且丧失痛觉时，将扁桃体剥离切除。大多数切口无须缝合，可自然愈合。患者一般术后住院观察24小时以上。一般认为扁桃体切除不会对以后的生活有任何不良影响。
有的家长因孩子经常扁桃体发炎，就要求大夫给孩子进行手术摘除扁桃体，但医生一般都会慎重考虑。扁桃体为什么不能随便摘除呢？
扁桃体是咽部最大的淋巴组织。在儿童时期，它是个活跃的免疫器官，含有各个发育阶段的淋巴细胞，如T细胞、B细胞、吞噬细胞等。所以它既具有体液免疫作用，产生各种免疫球蛋白，也有一定的细胞免疫作用。扁桃体产生的免疫球蛋白IgA免疫力很强，可抑制细菌对呼吸道黏膜的粘附，并可抑制细菌的生长和扩散，对病毒也有中和与抑制作用。IgA还可通过补体的活化，增强吞噬细胞的功能。这些在两岁至五岁时表现最为活跃。
从免疫的观点来看，由于其对身体的免疫作用，不应随便将扁桃体摘除。儿童扁桃体肥大是正常生理现象，如果肥大但未影响呼吸和吞咽，没有产生较重的临床表现，不应摘除。因为切除后可能会影响局部的免疫反应，降低身体抗感染的能力。如果扁桃体炎反复发作，妨碍呼吸和吞咽，引起风湿及肾炎等疾病时，应及时切除。一般儿童扁桃体切除术应在四岁以后进行，而且要等炎症消退后两周至三周切除比较适宜。但若发作过于频繁，不能久等，可考虑在发作消退后数天施行手术
