前言:
挑选到满意的sgRNA之后,就要开始正式实验,而正式实验中细胞转染部分我则不会再讲,直接到最关键的部分:挑取单克隆。
实验正文
1. 实验准备
常规试剂、仪器:转染试剂,流式分选,双抗,Incucyte
2. 实验步骤--将sgRNA插入pSpCas9质粒中
(1)Day 0: 质粒转染
还是同之前一样,将sgRNA-pSpCas9质粒转入到目的细胞中,此时根据可根据细胞不同,选用不同的转染试剂或转染方法。
(2)Day 2/3: 筛选
根据使用的Cas9骨架质粒的不同,筛选的方式也不同:
(1)带抗生素抗性基因的使用抗生素进行筛选;
(2)带荧光标签的细胞则可使用流式筛选:
在这里我选择方法(2)
(1)事先告知流式分选工作人员细胞类型、细胞大小、荧光类型等信息,以便提前调试仪器;
(2)首先将细胞消化为单细胞状态;
(3)使用带双抗的培养基吹打混匀,过了40/70 μm筛后立刻放置于冰上;以相同的手法,准备一管未转染的细胞为阴性对照;
(4)筛选后的细胞立刻置于冰上运输回细胞房;
(5)根据细胞的活力不同,对于皮实的细胞,可直接跳到下一步操作;对于人胚胎干细胞之类的较弱细胞,则需要种在24,12或者6孔板中扩增后,再进行下一步,用这种方法,在筛选后第二天仍可观察到荧光。
(3)挑取单克隆
筛选过后的细胞则按照1个/孔的密度种到96孔板中,放在Incucyte之类活细胞工作站监控,每天拍2-3张全孔扫描照片,7天后查看96孔板单克隆生长状况,反查第1天时的照片,确认是单细胞即可。以下是Incucyte的结果示例(因为连续视频有点大,因此放上day1和day10的图):
(4)Day 10(根据不同的细胞,选择不同培养时间)
将挑中的单克隆消化后接种到24孔板中扩大培养等待后续验证。
(5)没有可全孔扫描拍照的仪器怎么办
Incucyte是挑单克隆的利器,可全孔扫描的仪器也可使用,由于可以追踪到最早期的细胞个数,因此能确认细胞克隆是来自于单细胞。但Incucyte之类的仪器并不是所有平台都有,此时只能用老方法进行单克隆细胞挑取:
(1)找一个细菌接种环,将荧光细胞圈住,只消化这一颗细胞,之后种到96孔板中(难度很大);
(2)将细胞消化后,经由流式筛选,使用无限稀释法,稀释获取单细胞(很费96孔板,工作量很大);
(3)将细胞消化后,在荧光显微镜下,使用枪头吸取荧光细胞,种到96孔板中(难度仍然大,但是可操作性强);这个方法需要实验室拥有在超净台中的荧光显微镜。
试过之后,觉得方法(3)容易实现一些,可如下图所示:
(1)将显微镜灭菌;
(2)挑取绿色荧光细胞一个,挪到旁边的空白孔种放出,确认为单个后再吸起放入96孔板中;
对于转染难度低且皮实的细胞来说,挑取单克隆可以说是在我这个CRISPR-Cas9敲除方案中最难的一个实验,非常之关键。