下载miniconda
wget命令用来从指定的URL下载文件。
使用wget下载单个文件
>wget http://www.linuxde.net/testfile.zip
安装过程
命令
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
最后要记住激活!
source ~/.bashrc
清华镜像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
# 设置搜索时显示通道地址
conda config --set show_channel_urls yes
使用conda
1.查看condo列表
#conda列出当前环境所有包
conda list
- 搜索软件
#使用conda search搜索包(目的是查看可获得的版本)
conda search '包的名字' eg: conda search tensorflow
3.安装软件
#使用conda install命令安装包
conda install '包的名字'
conda install '包的名字'='版本号' eg: conda install tensorflow=1.10
conda install 软件名 -y #-y自动安装
以下提示安装不成功(可输入软件名字回车查看是否成功):
4.卸载软件
conda remove fastqc -y
conda 环境
让不同项目 可在不同环境下运行
1.查看conda 环境
conda info --envs #带*的就是默认的
conda info -e
2.环境创建和卸载
#conda新环境的创建
conda create -n '环境名' python='版本号'
#conda环境的卸载
conda remove -n '环境名' --all
附件: conda命令详解
usage: conda [-h] [-V] command ...
clean #移除不用的包和缓存文件
config #修改.condarc文件中的配置值,这里的.condarc文件类似于.vimrc或者.bashrc,用于配置conda的设置。模仿了git的配置命令,默认将配置写入到HOME文件夹下的.condarc文件中
create #从一系列特定的包创建一个新的conda环境
help #conda help文件
info #显示当前conda的信息,包括路径,channels等
init #初始化conda和shell的交互,实验性功能
install #在特定的环境安装一系列包
list #列出在一个conda环境中被linked(被关联)的包
package #低等级的conda软件包实用程序?(实验性功能)不晓得有什么用
remove #从一个特定的conda环境中移除一系列包
uninstall #remove命令的别名
run #在conda环境中跑一个可执行程序(实验性功能)
search #找寻包并显示相关的信息。输入是MatchSpec,一种结构化查询语言。理解为一种约定的查询方式?
update #把conda包更新到最新的兼容版本
upgrade #update命令的别名