KL社区发现算法概述与源码

本文在实现KL算法的过程中实现了社区划分结果,同时实现了不同社区的可视化结果。


author:xiao黄

缓慢而坚定的生长

公众号:Community Detection

本人更新在简书关于社区发现(Community Detection)方面的知识会同步更新到公众号中。


KL算法介绍

Kernighan-Lin算法是一种试探优化的方法,其基本的思想是为网络引入一个试探函数Q,Q代表某两个准社团内部的边数减去两个准社团之间的边数的差值,然后得到使Q值最大的划分方法。

首先将整个网络的节点随机的或根据网络的现有信息分为两个部分,在两个社团之间考虑所有可能的节点对,试探交换每对节点并计算交换后的ΔQ,ΔQ=Q交换后-Q交换前,记录ΔQ最大的交换节点对,并将这两个节点互换,记录此时的Q值。规定每个节点只能交换一次,重复这个过程直至网络中的所有节点都被交换一次为止。需要注意的是不能在Q值发生下降时就停止,因为Q值不是单调增加的,既使某一步交换会使Q值有所下降,但其后的一步交换可能会出现一个更大的Q值。在所有的节点都交换过之后,对应Q值最大的社团结构即被认为是该网络的理想社团结构。

KL算法是将网络分成两个指定规模大小的社区。


算法参数介绍

kernighan_lin_bisection(G, partition=None, max_iter=10, weight=‘weight’, seed=None)

G:图

partition:(元组格式)一对包含初始分区的iterables。如果未指定,则使用随机平衡分区。

max_iter:尝试交换在放弃前找到改进的最大次数。

weight:权重。如果没有,则所有权重都设置为1。

seed:随机数生成状态的指示器。

return:表示两个社区的一对节点。

返回类型:tuple(元组)


代码

import networkx as nx

import matplotlib.pyplot as plt

from networkx.algorithms import community  

from networkx.algorithms.community import kernighan_lin_bisection

def draw_spring(G,com):

    '''

    G:图

    com:划分好的社区

    node_size表示节点大小

    node_color表示节点颜色

    node_shape表示节点形状

    with_labels=True表示节点是否带标签

    '''

    pos = nx.spring_layout(G) # 节点的布局为spring型

    NodeId = list(G.nodes())

    node_size = [G.degree(i)**1.2*90 for i in NodeId] # 节点大小

    plt.figure(figsize = (8,6)) # 图片大小

    nx.draw(G,pos, with_labels=True, node_size =node_size, node_color='w', node_shape = '.')


    color_list = ['pink','orange','r','g','b','y','m','gray','black','c','brown']

    # node_shape = ['s','o','H','D']

    for i in range(len(com)):

        nx.draw_networkx_nodes(G, pos, nodelist=com[i], node_color=color_list[i],  with_labels=True)

    plt.show()

if __name__ == "__main__":

    G = nx.karate_club_graph() # 空手道俱乐部

    # KL算法

    com = list(kernighan_lin_bisection(G))

    print('社区数量', len(com))

    # print(com)

    draw_spring(G,com)


结果:

这就是KL算法划分的结果,分为两个社区,用不同的颜色表示出来。

可以用print(com)语句查看划分后社区中的节点。


参考文献:Kernighan B W, Lin S. A efficient heuristic procedure for partitioning graphs. Bell System Technical Journal, 1970 (49): 291-307.

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