1.MultiQC安装
pip install multiqc
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2.从网上下载fastq文件
prefetch SRR9111834
prefetch SRR6232298
3.将下载的文件转换成fastq格式
fastq-dump --gzip --split-files SRR9111834.sra
fastq-dump --gzip --split-files SRR6232298.sra
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4.用fastqc评价
fastqc SRR6232298_1.fastq.gz SRR6232298_2.fastq.gz SRR9111834_1.fastq.gz SRR9111834_2.fastq.gz
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5.multiqc报告解读
multiqc .
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最后结果如下:
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