MultiQC安装及运行

1.MultiQC安装

 pip install multiqc
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2.从网上下载fastq文件

prefetch SRR9111834
prefetch SRR6232298

3.将下载的文件转换成fastq格式

 fastq-dump --gzip --split-files SRR9111834.sra
 fastq-dump --gzip --split-files SRR6232298.sra
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4.用fastqc评价

fastqc SRR6232298_1.fastq.gz SRR6232298_2.fastq.gz SRR9111834_1.fastq.gz SRR9111834_2.fastq.gz
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5.multiqc报告解读

multiqc .
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最后结果如下:


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