使用3D-slicer软件自动勾画肝脏轮廓、分割肿瘤

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Tips: 在 install之后，记得点击右下角的restart 按钮重启一下软件

PART I 肝脏轮廓勾画

  1. 加载内置数据集[CTA abdomen(Panoramix)] (或者使用自己的数据)
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  1. 切换至Segment Editor模块
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  1. 选择annotation_ct_liver功能

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  2. 人工标注边界


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  3. 点击show 3D后，右上角会显示肝脏的3D效果。调节smoothing factor的大小肝脏边界会有不同的平滑效果。

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  1. 人工审核勾画效果，工笔修正
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  1. 保存分割文件，可以选择不同文件格式
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  1. 此外，还可以尝试使用全自动分割功能(但似乎目前只支持肝脏(肿瘤)及脾脏自动分割功能)。
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PART II 计算肝体积
2.1 切换至Data模块

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2.2 切换回Models,在information一栏中查看体积、表面积等信息
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肝脏体积为：817.610 ml

3D-slicer 还有很多其他强大的功能，值得进一步探索、发掘！

参考资料
AI-assisted segmentation using free tools - 3D Slicer and Nvidia Clara
3D Slicer中的测量工具

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