统计学

吴思涵老师推荐

  • 干货分享 实用生物统计手册以及配套的R代码
    好多统计学书都写得难啃,不光堆砌公式,连例子都不好好举。Handbook of Biological Statistics是我目前看着觉得最棒的一本生物统计学指南。虽然是英文的,但句子都写得很简单,一点都不拽文。公式推导能省则省(反正生物狗又不看),而且举的例子都是非常切合科研实际的。原作者免费公开全文在这个网站上:
    Introduction - Handbook of Biological Statistics
    书里的计算主要基于SAS,但是又有另外的大神,将里面几乎所有的实例,都用R来实现了。地址在这里:
    R Handbook: Purpose of this Book
    书里会介绍很多国内统计学课堂比较少涉及的好方法,比如Permutation test,可以通吃大多数非参检验,甚至在很多情况下,可以取代不够敏感的秩和检验(再也不怕秩和出来后P>0.05了😂)。不过很遗憾的是,貌似没有专门的章节,来介绍大数据比如基因组学中会用到的Kolmogorov-Smirnov test,Monte Carlo方法等。不过,这些google一下就有了。

李程老师推荐

北京大学生科院《基因组学数据分析》课程

  • 【进阶篇】Elements of Statistical Learning, Trevor Hastie等著,第二版PDF下载纸版
    如果只精读一本应用统计书,就是它了。可以先读第3、4、7、13、14、18章,再自选其他章阅读。读的时候,如果需要的话复习线性代数、随机变量、期望、条件概率等知识,要熟悉随机变量向量的求期望、求导等。深化所学理论的的方法:做每章后的能看懂的练习、结合理论和例子分析自己项目中的数据。

统计学R网站

Michael I Love是北卡教堂山大学生统与遗传系助理教授。研究方向为利用统计模型发现基因组数据中的生物为规律,并开发了Bioconductor中开源统计软件。

课程源代码:https://github.com/genomicsclass/labs 包括课程所有源代码、测试数据和结果

网页版教程: https://genomicsclass.github.io/book/ ,包括课程的Rmd运行结果网页教程,和Rmd源代码的每节导航和下载链接。

电子书:https://leanpub.com/dataanalysisforthelifesciences/ 方便下载各版本在移动端阅读

A Language, not a Letter: Learning Statistics in R

Y叔的统计学笔记

20200301-Statistical Rethinking with brms, ggplot2, and the tidyverse version 1.1.0
Rmarkdown 链接https://zenodo.org/record/3693202#.Xl4n9KgzZhE

统计可视化书籍,图特别漂亮。



第二节

Nature 下的 Statistics for Biologists

2021-Statistics With RSolving Problems Using Real-World Data

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