在小学《自然》课本里我们都学习过达尔文的进化论，那个时候我们对此深信不疑，而《如何形成清晰的观点》这本书的作者站出来质疑进化论，这一切未得到证明，是否是真实存在的？我们应从哪个点出发来思维一件事的逻辑、检验它的真实性，该书都给了我们明确且清晰的答案。
作者认为对于想要构建一个理论体系、要想针对一个根本问题得出一套观念，每个人都应该首先对前人的知识做一个完整的调查，记下一种科学分支下的每一个重要概念，观察他们在哪一方面取得了成功，又在哪里失败过，根据这些彻底的了解，得到对于哲学理论有价值的材料，认识到每种哲学理论的性质和有点，然后进一步研究哲学解决的问题和解决方法。
作者从伽利略开创力学开始分析，提到力学促进了当时机械论哲学的兴起，后又指出赫伯特·斯宾塞以力学规则为基础解释进化论的不合理处。
然后《如何形成清晰的观点》作者为当时流行的三种进化理论进行了分析，这三种理论分别是拉马克的进化理论、由克拉伦斯·金的进化理论和达尔文的进化理论。
拉马克的进化理论认为物种的发展是通过一些列不明显的变化发生的，但是这些变化是在个体的生命过程中发生的，是努力和练习的结果。除保留这些变化外，繁殖在这个过程中不起任何作用。作者认为这种理论是通过习惯和努力而起作用。
由克拉伦斯·金认为化石可以证明物种会在发生重大灾害、变迁或在新的环境下物种快速变化。这些原因是由生物侵入、食物改变、生活习惯打破而导致的。他认为这是由环境变化的影响和适应环境所驱使的，没有一个单一的步骤，无法察觉，不是努力决定的。相反，进化是受环境变化的影响，并且具有让生活体适应该环境的积极的普遍的趋势。因为一旦衰弱或受到刺激，这些变化对器官的影响就格外明显。作者认为此种观点似乎得到生物学和古生物学一些最广泛和最重要的事实支持，具有让生物体适应该环境的积极的普遍的趋势。
《如何形成清晰的观点》这本书里作者查尔斯·s·皮尔士对达尔文的进化论的假说是这样评价的：达尔文的进化论虽然毫无疑问极具独创性，构思精巧，论证渊博，逻辑严密，文辞优美，还具有某种几乎令人难以抗拒的真正魅力，但是似乎假说自从一开始就根本没有被证明，并且，对头脑清醒的人来说，这种情况比起20年前似乎更没有希望。达尔文学说所受到的极大支持和接受很大程度上得益于（当时那个）时代倾向于支持他的观点，尤其是因为他给贪婪理念带来的鼓励作用。
作者查尔斯.s.皮尔士.认为达尔文在物种起源中设想的自然选择论，从原核生物到人的整个过程中唯一的积极促变因素是偶然变异，为了确保有明显的进步方向，接下来必须有行动阻碍某些种类的繁殖，或刺激其他种类的繁殖，在自然选择中严格来讲是淘汰弱者，在性的选择中主要是美的吸引。
《如何形成清晰的观点》作者认为，达尔文的这种观点，只是把政治经济进程的观点延伸到了整个动物，植物生命领域。而当代大部分植物学家认为，那些令人称奇的精美的自然适应之所以会产生，是因为生物的环境过分拥挤，于是偶然拥有了微弱优势的生物，迫使其他生物处于不利于繁殖的境地，甚至在后者达到生育年龄之前就将他杀掉。在作者小的时候，有人把他们称作为主的智慧，在动物界，他认为这是一种机械个人主义，而这种机械个人主义又被认为是由贪婪带来的善，达尔文在标题上所写的——这是为了生存的斗争。而作者批驳了这种观点，认为他此种观点视“万物为己，魔鬼在后”。
作者查尔斯·s·皮尔士极其重视研究内容在研究程序上的可靠性，特别重视逻辑在实践中的检验以及对假定和信念的合理怀疑。书中介绍了逻辑学所遵循的指导原则及逻辑推导过程，指出确定信念的三种错误方法及逻辑学家常用的逻辑论证三种方法及它在心理规律上的应用。在如何辩证的思量归纳与概率的关系、还有用证明的方式对宗教问题进行的思考，都给我们怎样思考问题、分析问题、论证问题提供了可以借鉴的内容。通过作者的阐述，给读者呈现出一个实践主义者对世界的研究的心路历程他的一些主张直至现在还影响着我们。
