胃癌是全球第四大癌症死亡原因，而胃腺癌是其最常见的类型。治疗胃癌的努力使其中位生存率仅提高了七个月。由于胃癌对手术和辅助治疗的反应相对较低，以及风险因素在其发病率中的复杂作用，如蛋白质抑制剂 (PPI) 和病毒和细菌感染，我们旨在研究病理途径参与胃癌的发展，并通过系统生物学和生物信息学工具研究可能的药物。
在这项研究中，基于微阵列数据分析了蛋白质-蛋白质相互作用网络，并发现了可能的有效化合物。还重建了非编码 RNA 与编码 RNA 相互作用网络和基因疾病网络，以更好地了解潜在机制。发现化合物如阿米洛利、伊马替尼、奥美拉唑、曲格列酮、泮托拉唑和 福斯马替尼可能对胃癌治疗有效。在基因-疾病网络中，表明肝癌、乳腺癌、肝纤维化、前列腺癌、卵巢癌和肺癌等疾病通过特定基因与胃腺癌相关，包括hgf、mt2a、mmp2、fbn1、 col1a1 和 col1a2。
结果表明，细胞周期、细胞分裂和细胞外基质组织等信号通路过度表达，而消化和离子转运通路表达不足。基于多层次系统生物学分析，胃腺癌中枢基因参与了粘着斑、血小板活化、胃酸分泌、HPV感染和细胞周期等通路。假设 PPI 对胃癌患者有治疗作用。由于其对两个存活基因的抑制作用，Fostamatinib 似乎是一种潜在的胃癌治疗药物。然而，这些发现应该 通过实验研究证实。
Identification of hub pathways and drug candidates in gastric cancer through systems biology
Seyed Reza Salarikia, Mohammad Kashkooli, Mohammad Javad Taghipour, Mahdi Malekpour, Manica Negahdaripour
Scientific Reports 2022 June 1, 12 (1): 9099
