环状柱状图+散点柱状组合图绘制,基于SCIPainter

原文教程:环状柱状图+散点柱状组合图绘制,基于SCIPainter教程

本期教程

获得本期教程文本文档,在后台回复:20240725。请大家看清楚回复关键词,每天都有很多人回复错误关键词,我这边没时间和精力一一回复。

往期教程部分内容













写在前面

本期的教程代码是基于SCIPainter中的如何绘制Nat Commun同款环状+散点柱形图组合图表?进行调整,大家若是需要可直接进行访问此教程。

在原文中,两个图形的组合是使用AI工具进行合图。

为了方便大家后期的绘图,我们基于此教程的代码,使用cowplot包进行两个图形的合并。

注意:在我们此教程中只是展示部分的绘图代码,详细的教程代码可以访问如何绘制Nat Commun同款环状+散点柱形图组合图表?或是在我们后台绘图关键词,获得全部代码和数据

绘制环状柱状图

ggplot(data = dt,
       aes(x = as.factor(id),
           y = value,
           fill = time)) +
  geom_bar(stat = "identity")+
  geom_text(data = dt,
            aes(x = id, y = 10, ##'@高度调整
                label = sample, hjust = hjust),
            color = "black", size = 4,
            angle = dt$angle,
            inherit.aes = FALSE )+
  geom_text(data = dt,
            aes(x = id, y = 4,
                #label = round(value), #'@保留整数
                label = value,    #'@保留原数值
                #label = format(value, nsamll = 2), ##'@保留两位小数
                hjust = hjust),
            color = 'black', size = 4,
            angle = dt$angle,
            inherit.aes = FALSE )+
  scale_fill_manual(values = mycol)+
  ylim(-15, 15)+coord_polar(start = 0)

绘制散点柱状图

ggplot() +
  geom_bar(data = aov,
           aes(x = time, y = m, fill = time),
           stat="identity", color = NA, width = 0.8) + #add柱形图
  geom_point(data = dtt,
             aes(x = time, y = value),
             size = 2,
             position = 'jitter', fill = 'black')+
             scale_fill_manual(values = mycol) + #配色统一
  scale_y_continuous(expand = c(0,0), limits = c(0,15)) +
  geom_errorbar(data = aov,
                aes(x = time, y = m,
                    ymin = m-s, ymax = m+s),
                width = 0.3)+
  labs(x= NULL, y = NULL)+
  theme_classic() +
  theme(panel.grid.major = element_line(colour = 'grey90'),
        panel.grid.minor = element_line(colour = 'grey90'),
        legend.position = "none")

组图

library(cowplot)
# 组合图形
ggdraw() +
  draw_plot(p4, 0, 0, 1, 1) + # 将 p4 放在背景
  draw_plot(p7, 0.38, 0.4, 0.25, 0.25) # 将 p7 放在 p4 中间,调整位置和大小

参数调整:

1.  draw_plot(p,x,y,1,1)函数
p:放置的图形
x:左右X轴的位置调整
y:上下y轴的位置调整
1,1:x与y缩放大小/比例

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往期部分文章

1. 最全WGCNA教程(替换数据即可出全部结果与图形)


2. 精美图形绘制教程

3. 转录组分析教程

4. 转录组下游分析

小杜的生信筆記 ,主要发表或收录生物信息学教程,以及基于R分析和可视化(包括数据分析,图形绘制等);分享感兴趣的文献和学习资料!!

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