三体二的故事要从一段墓前对话开始。在杨东的墓碑前，前来扫墓的逻辑见到了来向女儿做最后道别的叶文洁。在这里，叶文洁向罗辑讲述了宇宙社会中的两条基本公理和两个重要概念。从此，三体的主角从叶文洁变成了罗辑。
与此同时，在伊文思生前与三体人的另一段对话中人类得知三体人的脑中没有伪装与计谋，他们的思维是透明的。而且因为对人类谎言的恐惧，他们不再信任伊文思。这就是为什么上一集里智子没有将古筝计划告知伊文思的原因。就这样，人类进入了危机纪元。
危机纪元第三年，罗辑受史强的邀请参加一个针对三体人的反击策略会议。大会公布了重要的反击策略那就是——面壁计划！
为了躲避智子的监视和利用三体人不懂得欺骗的弱点，大会选举出了四位面壁者。他们分别是美国前国防部长费里 德里克 泰勒；因为发展核武器而受到制裁的委内瑞拉现任总统曼努尔 雷迪亚兹；在人脑智力研究方面取得卓越成果并获得诺贝尔奖双提名的科学家比尔 西恩斯和受到叶文洁点拨并准备创立宇宙社会学的罗辑。
在大会上意外听到自己名字的罗辑十分的意外，他拒绝面壁者这一身份。但从面壁计划开始开始的一瞬间，四位面壁者的一切行为都被视为计划的一部分。罗辑愤怒的离开了大会。就在他打开会场大门的一瞬间，一发子弹击中了他的胸膛！他倒地身亡于是全剧终剧终！呵呵，开个玩笑。其实是史强给的防弹衣保住了罗辑的性命。
就在大会公布面壁计划的同时，准备吞枪自尽的ETO残党突然接收到了主（三体人）的旨意。三体人认为目前只有人类才能侦破人类的谎言，所以三体人决定重新启用ETO组织。他们针对地球人类的行为而做出了反击计划——挑选出破璧人侦破面壁者的计划。为三体人扫平障碍。罗辑没有面壁者是因为他将直接与主对决。这就是罗辑遭到刺杀的原因。
伤愈后的罗辑心想既然自己摆脱不了这个身份，不如就将错就错吧。于是就来到了一个背靠雪山，面朝湖泊的人间仙境碌碌无为的生活了几年。反正他是面壁者嘛，一切行为都被视为计划的一部分，联合国也不好干涉。
至于罗辑接下来的救世计划，我们下集再见。
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