做实验就像做菜,都可以按着protocol一步一步来,虽然不同人、不同时间做出来的结果参差不齐,不过有protocol在手总归是安心一些。氮素,做菜的protocol可以问度娘,实验的却不行(容易被带到沟里)。那么,到哪儿去找靠谱的protocol呢?对于许多初入生物科研的小白来说,要找到正确的Protocol并不容易,可能更多的是来源于师兄师姐的真传,但是每个人都有自己的实验习惯,可能经过几代后已经不明所以了,然后不求甚解的师弟师妹们就一直“错下去”。
今天我们来说说如何找到实验的Protocol.
1. 实验室通用的Protocol以及师兄师姐的实验记录,当然,这靠谱protocol的最佳来源首当其冲就是实验室的传承。通常实验室为了更好的培养新来的学生,会准备一份常规实验方法Protocol手册,这可都是你的师兄师姐无数次验证过的,有时甚至还会在经过血一般的教训后对其进行完善和补充的。
然而,这并不意味着你拿着这个protocol就可以照搬全抄,否则只能得到画虎不成反类犬的效果,毕竟每个实验都存在着不同的变量。此时,就需要谦虚认真的询问师兄师姐相关实验操作的具体细节,要知道,人有一张嘴,除了要吃遍四方外,更重要的是与他人沟通交流嘛。
但最怕就是,protocol虽是前辈们的亲授真传,但是由于每个人的实验习惯不同,很多protocol在传承几代后就不明所以了,而一些不求甚解的师弟师妹们就会一直这么“错下去”,使得实验结果会越跑越偏,甚至在歧路上一路绝尘而去。
所以做实验不仅要知其然更要知其所以然,实验的原理都搞不清楚,还妄想得到一个漂亮的实验结果,骚年们,你们可以洗洗睡了。这也是实验室传承说其protocol经典,而实验工具书嘿嘿冷笑的原因所在。
2. 工具书:书本对于传统的实验技术往往都是非常成熟的,也是值得信赖的,并且会有实验详细的原理步骤和注意事项的介绍,因此工具书对我们寻找Protocol是非常重要的。在此给大家推荐:分子生物学实验推荐查找《分子克隆实验指南》(中文版黄培堂译)。细胞实验相关推荐查找《细胞生物学实验指南》《动物细胞培养——基本技术指南》。蛋白质抗体相关的推荐:《蛋白质技术手册》、《蛋白质-蛋白质相互作用》、《Using Antibodies》、等,无不囊括了实验详细的原理步骤和注意事项的介绍。
而它们立在实验狗面前,堪称圣经般的存在,让人仰之弥高。虽说实验技术日新月异,可文献中介绍的方法往往会比较笼统,很多具体细节还要自己去摸索。常言道万变不离其宗,对这些书籍的仔细研读,定会让你受益匪浅。再辅之对师兄师姐的请教,对实验就会有更深的理解。
可谁料有童鞋长叹道,我不看书已经很久了,面对着如此厚重的书,倍感压力啊。确实,在这个互联网+的时代,还有什么是它搞不定的么?网络上的实验内容虽然鱼龙混杂,但是却不乏权威的网站,可让你蓦然回首,就会发现心中的protocol就在灯火阑珊处。
3. 各大公司的技术支持:现在对于很多的大公司都会有技术支持,找他们准没错,尤其是那些国外的大公司,你想要的他们都有,他们没有也会告诉你哪里能找到。他们的联系方式问“度娘”哈。
4. 网络:如果你手头的工具书非常有限,那么网络可能会是你的首选,但是网络内容太多太乱太杂,没有火眼金睛是很难找到你需要的东西的。
4.1 搜索引擎
不过多解释,想要在网上找东西,就靠 Google。
在此给出一点建议:多用 Google.com,多搜英文关键词。
推荐搜索引擎:Google.com, Bing.com
4.2 权威 Protocol 网站
网上有许多专门以 protocol 为主的网站,现举例最有名的:
(1). Nature Protocol
Protocol Exchange
https://www.nature.com/protocolexchange
Protocol Exchange是Nature Protocols打造的开放平台,涉及生物化学、微生物、植物学、医学、分析化学等35个领域。
进入Browse版块,可用关键词或主题搜索protocol,在页面左侧可根据研究领域、实验室、相关期刊、日期等再次筛选结果。
进入某一protocol,可点击reagents,procedure等查看相关内容,并利用print按钮保存为PDF文件或直接使用DOI号下载。
(2). Bio-protocol
https://cn.bio-protocol.org/cn/default.aspx
Bio-protocol打造了一个开放获取和沟通的平台,平台上的实验方案的有效性,均经过了已发表科研论文的认证。
搜索时可根据研究主题搜索,如DNA与蛋白互作:DNA-protein,出现了EMSA、CHIP等方法。
该平台对初学者相当友好,可使用中文检索。
(3). Morimoto laboratory
http://groups.molbiosci.northwestern.edu/morimoto/
Morimoto laboratory是美国西北大学Morimoto 实验室创建的分享平台,平台除了展示实验室的成就和风貌,还留下了许多经过实践检验的protocol和技术工具,非常有爱了~
4.3 权威杂志网站
Current Protocols
https://currentprotocols.onlinelibrary.wiley.com/
current protocols涉及分子生物学、生物医学、生物化学、农业等19个学科,其中17个学科保持出版更新。每册实验室指南保留不同阶段的实验过程记录,同时每年更新4次,每册实验室指南每年更新至少500页内容,以保证各册指南都能体现各自领域的最新发展情况。
实验指南上不仅有材料清单,还有一些实用的小提示和图表(有的地方还有视频),帮助用户设计并实施实验。每一篇文章里还有很多讨论的部分,比如说Critical Parameters(实验的关键部分)、Troubleshooting(如何解决实验无效的问题)、Anticipated Results(实验顺利的情况下能得到的结果)。
氮素,使用Current Protocols有个致命的问题就是要收费(可以整本下载)!!!目前没有很好的解决方法。不过,遇到想要下载的protocol可以先用sci-hub试试。还有一些高校偶尔会开通Current Protocols的试用,遇到这种千载难逢的机会一定不要错过啊~
类似的网站还有:Springer Protocols(Springer Protocol 最大的优势,就是可以在线管理属于自己的 Protocol,而且其中很多实验方法,多来自经典实验参考书 Methods 系列),《Nature Protocols》杂志文章则倾向于描述详细的实验步骤及注意事项,以便使读者可以快速将该实验方法应用于各自领域的研究。而《Nature Methods》杂志主要发表生命科学领域中新的研究方法或对经典方法有显著改进的相关论文。Cold Spring Harbor Protocols,Nucleic Acids Research Methods,Biotechniques等,其搜索方式与查找文献类似,这里就不重复说明啦~
4.4 生物 / 医学实验视频
JoVE
https://www.jove.com/
JoVE全称 Journal of Visualized Experiments,该网站是专门收集实验操作和视频的学术网站。觉得看 Protocol 很枯燥的同学,可以考虑看看这个,绝对叼炸天。视频由专业技术人员录制,每一步实验都有关键提醒,PDF文件也是可以下载的。
友情提示:下方是图片不是视频哦
另外一些微信号的推送也是很不错的protocol来源:分子生物学实验大集合 https://mp.weixin.qq.com/s/xukjXMUeR9he05rX8MBLiA
参考链接:
https://www.biomart.cn/experiment/793/2713182.htm
https://mp.weixin.qq.com/s/nkkS4eNrNqQg2k4ISiafkg
http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI3MTEyOTM4Mg==&mid=2659463472&idx=1&sn=d130437ff27f5aa4764877a77eed97c0&mpshare=1&scene=24&srcid=0425iRFfrDJw4XGwEBfcwdOE#rd