今天开始学习R语言中的数据结构,内容如下:
向量及相关操作
定义
向量:多个元素(数字或者字符串)组成的变量。有时候也需要将向量或一串字符或数据框进行赋值
比如如下代码
x<- c(1,2,3) #常用的向量写法,意为将x定义为由元素1,2,3组成的向量。
x<- 1:10 #从1-10之间所有的整数
x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数(注意是逗号不是分号)
x<- rep(1:3,times=2) #1~3 重复2次
从向量中提取元素
根据元素位置
例如
x[3] #第3个元素
x[-3] #排除法,除了第3个元素之外剩余的元素
x[5:8] #第5到8个元素
x[-(5:8)] #除了第5-8个元素
x[c(2,3)] #第2个和第3个元素
根据具体的值
例如如下代码
x[x==10] #等于10的元素
x[x<4] #<4的元素
x[x %in% c(1,4,6)] #存在于向量c(1,4,6)中的元素
数据框
数据框即我们通常所说的表格
读取数据
读取数据前首先要设置工作目录
setwd("C:\\Users\\fxiao\\Desktop\\生信学习小组")
read.table(file ="huahua.txt",sep="\t",header =T)
a<-read.table(file ="huahua.txt", sep ="\t", header =T)
设置行名和列名
X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号,1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据,左上角第一格为空,R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名
数据框的导出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号,字符串不加双引号(默认格式带由双引号
变量的保存与重新加载
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令
提取元素
- X[x,y]#第x行第y列
- X[x,]#第x行
- X[,y]#第y列
- X[y] #也是第y列
- X[a:b]#第a列到第b列
- X[c(a,b)]#第a列和第b列
- X$列名#也可以提取列(优秀写法,而且这个命令还优秀到不用写括号的地步,并且支持Tab自动补全哦,不过只能提取一列)
题:save(X,file="test.RData")
这句代码如果报错object X not found,是为什么,应该怎么解决?
答:这里提示没有找到X,说明X没有被赋值,区分前面代码中的大小写,给X重新赋值后再保存 。