前言
昨天已经开始入门Linux的一些基本操作命令了，今天继续Linux的软件安装。
什么是Conda
- conda是一款软件管理软件，相当于windows里面的应用商店。miniconda和anaconda中都包含了conda。miniconda windows 64位安装包大小为51.4 Mb，只包含了conda、python、和一些必备的软件工具anaconda windows 64位安装包大小为462 Mb，是miniconda的扩展，包含了数据科学和机器学习要用到的很多软件。
下载miniconda
打开清华大学的镜像站https://mirror.tuna.tsinghua.edu.cn/help/anaconda/，进入miniconda下载目录，可以看到不同系统的下载版本。
Miniconda下载目录.png
下面，让我康康我们的云服务器是什么系统。命令为 uname -a
bio16@VM-0-6-ubuntu:~$ uname -a
Linux VM-0-6-ubuntu 4.15.0-118-generic #119-Ubuntu SMP Tue Sep 8 12:30:01 UTC 2020 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux
很明显为X86_64！！！那我们就选择对应的系统进行下载。
进入biosoft目录，开始下载。
bio16@VM-0-6-ubuntu:~$ cd biosoft
bio16@VM-0-6-ubuntu:~/biosoft$ pwd
/home/bio16/biosoft
bio16@VM-0-6-ubuntu:~/biosoft$ wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py38_4.9.2-Linux-x86_64.sh
貌似下载成功
貌似下载成功.png
安装miniconda
代码为bash Miniconda3-py38_4.9.2-Linux-x86_64.sh，Bash英文翻译为进入子程序，
bash Miniconda3-py38_4.9.2-Linux-x86_64.sh
期间一直enter，然后yes即可安装。
貌似安装成功
貌似安装成功.png
激活miniconda
命令为source ~/.bashrc再输入conda
(base) bio16@VM-0-6-ubuntu:~/biosoft$ source ~/.bashrc
(base) bio16@VM-0-6-ubuntu:~/biosoft$ conda
貌似激活成功
貌似激活成功.png
添加镜像
以下为代码
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
使用conda
1.查看当前服务器上安装的所有软件列表
命令为conda list
(base) bio16@VM-0-6-ubuntu:~/biosoft$ conda list
2. 搜索conda软件（以fastqc为例）
命令为conda search fastqc
(base) bio16@VM-0-6-ubuntu:~$ conda search fastqc
Loading channels: failed
搜索几次都失败，老师说不管了，直接安装。
3. 安装软件
命令为conda install fastqc -y
(base) bio16@VM-0-6-ubuntu:~$ conda install fastqc -y
一系列代码后，貌似安装成功了。
貌似安装成功.png
4.卸载软件
命令为conda remove fastqc -y
(base) bio16@VM-0-6-ubuntu:~$ conda remove fastqc -y
Collecting package metadata (repodata.json): done
Solving environment: done
思维图
Linux系统的软件安装.png
