EOF经验正交分解(PCA)

EOF经验正交分解(PCA)

1.PCA与EOF的区别和联系

  1. 经验正交函数分析方法(empirical orthogonal function,缩写EOF)也称特征向量分析(eigenvector analysis),或者主成分分析(principal component analysis),是一种分析矩阵数据中的结构特征,提取主要数据特征量的一种方法。可以知道这两者是同一种分析方法,只是称号不同。

  2. 两者叫法不同,主要是关注的侧重点不同。

    ​ 在EOF中,我们更加关注得到的协方差矩阵的特征向量,也叫做空间特征向量(空间模态)。第i个特征向量就叫做第i个模态:EOF_{i}。空间模态在一定程度上反映了要素场的空间分布特点,如果是针对气象数据的计算,那么就是重新拟合的要素场或者说是模态。PC(主成分)对应时间变化,也称为时间系数,反映相应空间模态随时间的权重变化。

    ​ 在PCA中,主成分分析以最少的信息丢失为前提,将众多的原有变量综合成较少几个综合指标,也叫主成分。

​ 从数学上可以证明,原变量协方差矩阵的特征根是主成分的方差,所以前m个较大特征根就代表前m个较大的主成分方差值;原变量协方差矩阵前m个较大的特征值\lambda_{i}(这样选取保证主成分的方差依次最大)所对应的特征向量就是主成分PC_{i}表达式的系数a_{i},为了加以限制,系数a_{i}对应的特征向量进行了单位化。<font color = blue>看完后面再看</font>

2.数学原理与算法

  • 选定要分析的数据,进行数据预处理,通常处理成距平的形式,得到一个数据矩阵X_{m\times n}。m代表单个数据有m个维度,n代表时间上采样n次。
    \begin{align}X &= (x_{ij}) \\ &= \begin{bmatrix} x_{11} & x_{12} & \dots & x_{1n} \\ x_{21} & x_{22} & \dots & x_{2n} \\ \vdots & \vdots & \dots & \vdots \\ x_{m1} & x_{m2} & \dots & x_{mn}\end{bmatrix},\\ {\color{Blue} } &(i = 1, 2, \dots ,m;j = 1, 2, \dots ,n).\end{align}
  • 计算X与其转置矩阵X^{T}的交叉积,得到方阵
    C_{m\times m} = \frac{1}{n}X \times X^{T}
    如果X是已经处理成距平的话,则C称为协方差矩阵;如果X已经标准化(即C中每行数据的平均值维0,标准差为1),则C称为相关系数阵。

  • 计算方阵C的特征值(\lambda_{1,\dots,m})和特征向量V_{m\times m},二者满足
    C_{m\times m} \times V_{m\times m} = V_{m\times m} \times \wedge_{m\times m}
    其中\wedgem\times m维对角阵,即
    \wedge = \begin{bmatrix} \lambda_{1}& 0& \dots& 0 \\ 0 & \lambda_{2} & \dots & 0 \\ \dots & \dots & \dots & \dots \\ 0 & 0 & \dots & \lambda_{m} \\\end{bmatrix}
    一般将特征值\lambda从大到小排列,反映各个主成分重要性。==因为数据X是真实的观测值,所以\lambda应该大于或者等于0==。每个非零特征值对应的一列特征向量就是EOF。\lambda{1}对应的特征向量值称为第一个EOF模态,也就是V的第一列即EOF_{1} = V(:, 1);第k个特征值对应的特征向量为V的第k列,也叫做第k个模态。

  • 计算主成分。将EOF投影到原始数据矩阵X上,就得到所有空间特征向量对应的时间系数(即主成分),即
    PC_{m\times n} = V^{T}_{m\times m} \times X_{m\times n}
    其中PC中每行数据就是对应每个特征向量的时间系数,第一行PC(1, :)就是第一个EOF的时间系数,其他类推。

上面是对数据矩阵X进行计算得到的EOF的主成分(PC),因此利用EOF和PC也可以完全恢复原来的数据矩阵X,即
X = EOF \times PC
有时可以用前面最突出的几个EOF模态就可以完全拟合出矩阵X的主要特征,此外,EOF和PC都具有正交性的特点,可以证明\frac{1}{n}PC\times PC^{T} = \wedge ;即不同的PC之间相关性为0。同时各个模态之间相关为0,是独立的。

3.常用的计算方法

  1. 直接使用eig方法

    [EOF, E] = eig(C)
    

    其中EOF为计算得到的空间特征向量,E为特征根。

  2. 直接对矩阵X进行奇异值分解
    X = U\sum V^{T}

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