《学习小组Day6笔记--大大不留跟》

练习dplyr包的常用方法

library(dplyr)
test <- iris[c(1:2,51:52,101:102),]
##--------------------dplyr五个基础函数---------------------#
#1、mutate()新增列
mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width)
#Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width    Species
#1          5.1         3.5          1.4         0.2     setosa
#2          4.9         3.0          1.4         0.2     setosa
#3          7.0         3.2          4.7         1.4 versicolor
#4          6.4         3.2          4.5         1.5 versicolor
#5          6.3         3.3          6.0         2.5  virginica
#6          5.8         2.7          5.1         1.9  virginica
#new
#1 17.85
#2 14.70
#3 22.40
#4 20.48
#5 20.79
#6 15.66
#2、select()按列筛选
select(test,1)
#Sepal.Length
#1            5.1
#2            4.9
#51           7.0
#52           6.4
#101          6.3
#102          5.8
select(test,c(1,5))
#Sepal.Length    Species
#1            5.1     setosa
#2            4.9     setosa
#51           7.0 versicolor
#52           6.4 versicolor
#101          6.3  virginica
#102          5.8  virginica
select(test,Sepal.Length)
#Sepal.Length
#1            5.1
#2            4.9
#51           7.0
#52           6.4
#101          6.3
#102          5.8
select(test, Petal.Length, Petal.Width)
#Petal.Length Petal.Width
#1            1.4         0.2
#2            1.4         0.2
#51           4.7         1.4
#52           4.5         1.5
#101          6.0         2.5
#102          5.1         1.9
vars <- c("Petal.Length", "Petal.Width")
select(test, one_of(vars))
#Petal.Length Petal.Width
#1            1.4         0.2
#2            1.4         0.2
#51           4.7         1.4
#52           4.5         1.5
#101          6.0         2.5
#102          5.1         1.9
#3、filter()筛选行
filter(test, Species == "setosa")
#Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species
#1          5.1         3.5          1.4         0.2  setosa
#2          4.9         3.0          1.4         0.2  setosa
filter(test, Species == "setosa"&Sepal.Length >5)
#Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species
#1          5.1         3.5          1.4         0.2  setosa
filter(test, Species %in% c("setosa","versicolor"))
#Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width    Species
#1          5.1         3.5          1.4         0.2     setosa
#2          4.9         3.0          1.4         0.2     setosa
#3          7.0         3.2          4.7         1.4 versicolor
#4          6.4         3.2          4.5         1.5 versicolor

#4、arrange(),按某1列或某几列对整个表格进行排序
arrange(test, Sepal.Length) ##默认排序为从小到大
arrange(test, desc(Sepal.Length))  ##使用desc进行从大到小排序
#Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width    Species
#1          7.0         3.2          4.7         1.4 versicolor
#2          6.4         3.2          4.5         1.5 versicolor
#3          6.3         3.3          6.0         2.5  virginica
#4          5.8         2.7          5.1         1.9  virginica
#5          5.1         3.5          1.4         0.2     setosa
#6          4.9         3.0          1.4         0.2     setosa

#5、summarise()汇总
summarise(test, mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))
#mean(Sepal.Length) sd(Sepal.Length)
#1           5.916667        0.8084965

###(先按照species分组,再计算每组sepal.length的平均值与标准差)
group_by(test,Species) 
# A tibble: 6 x 5
# Groups:   Species [3]
#Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species   
#*        <dbl>       <dbl>        <dbl>       <dbl> <fct>     
#  1          5.1         3.5          1.4         0.2 setosa    
#2          4.9         3            1.4         0.2 setosa    
#3          7           3.2          4.7         1.4 versicolor
#4          6.4         3.2          4.5         1.5 versicolor
#5          6.3         3.3          6           2.5 virginica 
#6          5.8         2.7          5.1         1.9 virginica 
summarise(group_by(test, Species), mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))
#A tibble: 3 x 3
#Species    `mean(Sepal.Length)` `sd(Sepal.Length)`
#<fct>                     <dbl>              <dbl>
#  1 setosa                     5                 0.141
#2 versicolor                 6.7               0.424
#3 virginica                  6.05              0.354

#-----------------------dplyr使用功能--------------------------#
#(1)
test %>%
  group_by(Species) %>%
  summarise(mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))
#A tibble: 3 x 3
#Species    `mean(Sepal.Length)` `sd(Sepal.Length)`
#<fct>                     <dbl>              <dbl>
#  1 setosa                     5                 0.141
#2 versicolor                 6.7               0.424
#3 virginica                  6.05              0.354

#(2)
count(test,Species)
#Species        n
#<fct>      <int>
#  1 setosa         2
#2 versicolor     2
#3 virginica      2

##-----------------------------dplyr处理关系数据--------------------#
##不能引入factor
options(stringsAsFactors = F)
test1 <- data.frame(x = c('b','e','f','x'), 
                    z = c("A","B","C",'D'),
                    stringsAsFactors = F)
test1
#  x z
#1 b A
#2 e B
#3 f C
#4 x D

test2 <- data.frame(x = c('a','b','c','d','e','f'), 
                    y = c(1,2,3,4,5,6),
                    stringsAsFactors = F)
test2 
#  x y
#1 a 1
#2 b 2
#3 c 3
#4 d 4
#5 e 5
#6 f 6

#(1)inner_join (交集)
inner_join(test1, test2, by = "x")
#  x z y
#1 b A 2
#2 e B 5
#3 f C 6
#(2)left_join (以左侧集合为主,右侧没有的以缺失值表示)
left_join(test1,test2,by = "x")
#  x z  y
#1 b A  2
#2 e B  5
#3 f C  6
#4 x D NA
#(3)full_join  (并集)
full_join(test1,test2,by = "x")
#  x    z  y
#1 b    A  2
#2 e    B  5
#3 f    C  6
#4 x    D NA
#5 a <NA>  1
#6 c <NA>  3
#7 d <NA>  4
#(4)semi_join  返回能够与y匹配的x表记录
semi_join(x = test1, y = test2, by = "x")
#  x z
#1 b A
#2 e B
#3 f C
#(5) anti_join  返回无法与y表匹配的x表记录
anti_join(x = test2, y = test1, by = "x")
#  x y
#1 a 1
#2 c 3
#3 d 4
#(6) 其他
test1 <- data.frame(x = c(1,2,3,4), y = c(10,20,30,40))
test1
#   x  y
# 1 1 10
# 2 2 20
# 3 3 30
# 4 4 40
test2 <- data.frame(x = c(5,6), y = c(50,60))
test2
#  x  y
#1 5 50
#2 6 60
test3 <- data.frame(z = c(100,200,300,400))
test3
#z
#1 100
#2 200
#3 300
#4 400

bind_rows(test1, test2)   ##两集合列数相同
#  x  y
#1 1 10
#2 2 20
#3 3 30
#4 4 40
#5 5 50
#6 6 60
bind_cols(test1, test3)  ##两集合行数相同
#  x  y   z
#1 1 10 100
#2 2 20 200
#3 3 30 300
#4 4 40 400

内容来源--微信公众号生信星球

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 204,921评论 6 478
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 87,635评论 2 381
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 151,393评论 0 338
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 54,836评论 1 277
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 63,833评论 5 368
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 48,685评论 1 281
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 38,043评论 3 399
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 36,694评论 0 258
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 42,671评论 1 300
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 35,670评论 2 321
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 37,779评论 1 332
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 33,424评论 4 321
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 39,027评论 3 307
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 29,984评论 0 19
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 31,214评论 1 260
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 45,108评论 2 351
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 42,517评论 2 343

推荐阅读更多精彩内容