人类经过与大自然的顽强斗争，不断的征服和改变，终于以主人的身份生存和发展，并以自己的聪明才智不断地攫取大自然中的能量，从适应，征服，到改变，再到发展，最后创新，以个人或集体的智慧和力量，殚精竭虑，前仆后继，不断地创造着越来越高的文明，改善着人类的生活方式，提高着人类的生活水平，彻底的进入了人类主宰自己命运的时代。
《文明之光》第二册讲述了人类开始用科学的眼光理性的对待自然现象，并通过一代代科学家的探索，继承，发展，征服了自然，改造了自然。从微小的生物世界到外太空的遥远星球，人类的足迹逐一抵达。
曾经的人类面对未知的大自然，匍匐在它的脚下，对于不能解释的世界只能归结于神鬼的力量。当尼罗河河水肆虐泛滥的时候；当雷雨交加，电闪雷鸣的时候；当山体滑坡，石块滚落的时候……我们战战兢兢，跪拜祈祷，以为神发怒了抑或鬼的阻挠，除了祈求进献之外无能为力。
我们就这样卑微的生活了几万年，听任大自然的摆布，懦弱而无奈，无所适从。但是在自然和自然规律隐没在黑暗中的时候，牛顿来了，于是，万物遂成光明。
正如法国启蒙运动思想家伏尔泰所说：“迄今为止，牛顿的哲学对许多人来说，似乎像古人一样高深莫测。但是，希腊人的哲学从其产生以来实际上已经暗淡无光，而牛顿的哲学从离我们及其遥远的光芒之处生起。他发现了很多真理，……，把它们发掘出来并置于充分的光明之中。”
牛顿站在巨人的肩上，但他不轻信结论，用实验和数学计算验证前人的看法。当一丝阳光从门缝中射进来，牛顿看到了不一样的神奇。他用三棱镜截住阳光，折射到墙上的是彩虹的颜色。于是牛顿解开了光学的奥秘，推翻了笛卡尔的假说。
牛顿用万有引力定律揭开自然界神秘面纱。行星围绕太阳运动是因向心力的作用。而遵守这种向心力的运动轨道是椭圆的。他不是通过现象的猜测而是从他建立的经典力学理论推导出来的。在认识万有引力定律的过程中，牛顿提出了运动的三个运动规律，就是今天物理学教科书中的力学内容之一。
牛顿的发现，彻底揭示了物体之间相距吸引的秘密，上帝确定的自然法则不再神秘，我们对自然的认识从感性上升到了理性。自此人类开始用理性的眼光对待一切已知和未知，人类从此在大自然面前站起来了！人类的科学时代已然来临！
而科学的结论却不是现成的理论或概念供人类使用，它是科学家们经过反复的研究，实验，质疑，纠错而历经千回百转，长年累月的工作而得出的。这些结果闪耀着耀眼的光芒，照亮了人类的世界！笛卡尔的方法论，是文艺复兴以来，第一个为人类争取并保证理性权力的人；牛顿的万有引力定律引导人类进入理性时代；拉瓦锡的质量守恒定律奠定了化学的基础；焦耳的分子运动论向后世科学家展示了对比试验条件和实验设计的重要性；达尔文的生物进化论，以全新的生物进化思想，推翻了神创论和物种不变论。
科学家们的发明创造使人类的生活越来越舒适惬意，丰富而便利。然而当我们坐在明亮的客厅里欢声笑语时；当我们坐在影院或剧场中沉浸在剧情的世界中；或者走在华灯初上的繁华街头……当我们拿着手机和最想念的人视频倾诉如在身边时；当我们坐高铁或飞机几个小时甚至几分钟到达目的地时，或者是在网络的世界里无所不能时……我们可曾想到，这些现代化的交通，通信，电气化的现代生活是怎样来的呢？我们所享受的现代文明是怎样发展到今天的？
史蒂芬森的蒸汽火车头和达灵顿铁路开创了
火车和铁路的时代。英美铁路，日本新干线，中国的高铁建设，虽然都经历了某个私欲膨胀的个人不光彩的造假和敛财，却成就了今天的交通的飞速发展。
通信从莫尔斯电码开始，到发报机，再到贝尔的电话，美国人乔治·伊科的电话交换机，帕克医生的电话号码，缩短了人类之间的时间和空间的距离。
交通和通信的便利，曾使聪明的军事家毛奇以此为基础，产生了新的作战方法和新的战争指挥系统。这不由得使我们想起战争影片中“哒哒哒”的发报声和手摇式电话机“喂喂喂”的通话声。这些场景早已相去甚远，但却又似在昨日。人类的生活已经在不知不觉中进入了高度文明，高度富裕，高度理性的新时代！
但这样的文明和富裕，却是以能源为基础的。电的发明和使用促进了第二次工业革命，也催生了各种电器的发明，电影，电视机，洗衣机，电冰箱，微波炉，空调、计算机……同时大批新产业：化工，材料，冶金，建筑……然而这些现代化的产品和产业，离开电却寸步难行。
早期的电靠蒸汽和水力发电；二战时靠煤和水力；而太阳能，风能，地热能各有其局限性；核能是唯一没污染，取用不竭的能源。
最早的核能被西拉德证实后，用于为罗斯福研制原子弹，于是出现了在日本广岛长崎的轰炸事件。现在各国仍在大力开发核能，在核能的利用上我们应该学习法国，多向民用倾斜，裁撤核部队，缩小海空核规模。不要像某些国家一样只知道制造核武器，搞军备竞赛，威胁人类安全。我们要正确利用核能，造福人类！
《文明之光》第二册用大量的篇幅讲述了科学在推动人类进步的进程中所起的巨大力量，赞扬了科学家们忘我的钻研精神和严谨的科学态度，同时也提出了新时代各国的主要目标应该放在富国强民上，放在创造更高的文明上，放在使文明为人类提供更好的生活上。
这是作者在讲述荷美英最后统治世界而葡萄牙、西班牙却由最富沦为最穷的国家的时候提出的警示。就如本书的最后一章中的苏美的航天竞赛，从来就不是科罗廖夫和冯·布劳恩两个人的竞赛，而是两国综合国力的竞赛。
合上书本的刹那，眼前浮现的是量筒，烧杯，三棱镜，手稿，一个个模型，一本本科学巨著，一张张凝神思索的面孔……从卡罗角的夕阳到尼德兰的渔船，再到亚当·斯密那只“看不见的手”，还有北美十三州的冗长谈判……历史从来不会偏袒和歪曲，它公正而清晰地展示着正义和公平。
