作图群体及作图方法

作图群体

    在学习数量遗传学课程时,经常碰到诸如DH群体等名词,还是需要把相关的专业名词积累一下。作图群体概念及分类介绍 - 简书 (jianshu.com) 这一篇文章是我看到比较全面的一篇,根据这一篇的内容整理成本篇学习笔记。

目的

    首先,不要盲目构建群体,要根据自己的目的和材料特性来选择。比如,对于自交作物,一般构建重组自交系群体(RIL);对于异交作物及自交不亲和材料多采用回交群体(BC);而双单倍体群体(DH)在这些材料中都适用。如果不明白自己构建群体的目的和构建哪个群体,会浪费大量时间精力。

群体介绍

    首先总览一下各种群体,个人认为用到自然群体本身较少,且本身文章对其介绍不多,仅在总览图中描述一下自然群体。


各类群体总览

    接下来我们对各个群体进行逐个介绍,包括群体的配置方式(图文)和优缺点。在这里,先放上各个群体间的关系和如何得到的简图,做一个总览。

来源:Mapping Population: Types and Method of Production (biotecharticles.com)

    该图展示的群体较少些,但也是个人认为使用较多的。来源一个国外的生物学相关文章的网站,文章讲述的也是各种群体的配置和优缺点,感兴趣的朋友可前往浏览。

来源:Molecular markers in plants: Concepts and applications

这张图相较于前一张群体更多些,但是图片找不到更清晰的了。

接下来对各个群体做一个较详细地介绍,包括配置方式(图文)和优缺点。

初级作图群体介绍

F2群体
BC群体

永久性作图群体

RIL群体


IF2群体


DH群体

衍生系群体

NILs群体


其他衍生系

代换系

该群体未找到图解,图片为一篇论文中的构建方法


其他代换系

    以上所有就是双亲本群体的情况,有时候我们还看到一些多亲本群体,比如玉米。在介绍多亲本群体前,我们先看一下双亲本的缺点,这也能反映为什么会需要多亲本群体。

双亲本群体的缺点

多亲本群体

NAM群体


MAGIC群体

结语

    以上就是各群体的一个介绍。在整理过程中也发现有一篇论文(作物QTL定位常用作图群体)与这些内容相似,需要了解的朋友也可以去浏览。

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