1、需求:根据染色体位置大小提取indel 信息
我的目的基因在chr4 染色体1349548769-1349551625
先将染色体4号的indel 提取出来
grep 'chr4' indel.vcf > chr4_indel.vcf
然后再提取目的区域信息
grep '13495[4-5][0-9][0-9][0-9][0-9]' chr4_indel.vcf > ss_indel.txt
取出的信息上下游包含了都多了几kb 的信息,需要再挑选下,数据比较少就直接鼠标选择一下。
我的目的基因在chr4 染色体1349548769-1349551625
先将染色体4号的indel 提取出来
grep 'chr4' indel.vcf > chr4_indel.vcf
然后再提取目的区域信息
grep '13495[4-5][0-9][0-9][0-9][0-9]' chr4_indel.vcf > ss_indel.txt
取出的信息上下游包含了都多了几kb 的信息,需要再挑选下,数据比较少就直接鼠标选择一下。