MES系统软件（企业资源管理），是指建立在信息技术基础上，以系统化的管理思想，为企业决策层及员工提供决策运行手段的管理平台。自20实际90年代，该系统被提出以来，经过人们的不断实践，以及计算机信息技术的高速发展，使得MES系统软件的功能越来越完善，越来越多的领域开始引入,这一全新的管理理念。
根据国际MES系统软件公司内网提供资料显示：全球发达国家超过50%的大中型医院都已经实施了MES系统软件。更多的医院是处于一个了解和观望的态度来面该系统，很多企业的实施的成功经验高速了我们，不管是对于医院还是其他的企业来说，软件的成功实施都是有着重要的作用的。对于目前的国内来说，医院的江苏MES系统软件的发展还处于发展阶段，人们更多的是处于一个了解的阶段，那么医院实施这样的管理方式会有怎样的效果呢。
目前医院MES系统软件的实施，更多的是体现在以MES系统为核心支撑，构建财务管理和业务管理集成的系统管控平台，提升医院信息化和财务管理能力。
关于财务和成本核算问题：
目前部分医院实施EPR系统软件首先集中在财务系统上。在有些医院案例中，财务系统目标是实现“财务会计与管理会计的高度统一。”对于财务会计而言，国家层面上《中华人民共和国财务会计准则》、卫生部财务部也有对医院财务管理的要求规范，部分地方政府甚至要求医院统一使用规定的医院财务软件。这样，所有的医院财务软件在财务会计系统上要求基本相同。而真正的反应医院管理运营思路的是成本会计体系，医院成本核算系统之所以薄弱，主要原因在于医院本身没有成熟规范的管理思路和运营模式，成本核算的途径和方法有若干种，医院是无论是通过系统反应的管理思路来提升自己的管理水平，还是先提升了自己的管理水平通过系统得以实现，都必须明确的选择或者建立自己的成本核算的体系和思路。
引入成本核算系统后，医院的管理理念几乎焕然一新，其中最大的变化莫过于科室人员经营意识的增强。通过将每个科室的运行情况进行核算，管理层就能清晰地了解科室运行状况，在数据的烛照下，晦暗不清的科室成本黑洞终于逐渐清晰起来。但当成本核算工作越推向纵深，就会发现这些工作都无法直接产生经济效益，若想达到优质、高效、低成本的目标，管理者必须要改进和优化工作流程和环节，立足深层次的数据分析，把管理的视线引入每一个工作环节，利用业务流程再造、临床路径、作业成本法等各种管理工具，改进全院的每一项流程。
如果说作为基础层面的成本核算的任务就在于算清成本和收益，LED电子看板控制层面的物流、资产和薪酬管理是最大限度地优化人、财、物流动的通道，那么更进一步的工作就是要做好决策 分析。总的来说：一是预算管理，二是绩效考核。成熟的预算与支出管理与传统计划经济下的预算与支出管理判然有别，后者的内容无非就是预算该年收入几何，支出几何，收支平衡过后是赤字还是黑字，然后据此安排该年的开支，而前者的精髓在于加强管理环节的控制力度，通过合理的测算和管理工具算出每个考试的运营情况和支出情况，管理者据此就可以借助目标管理给每个科室主任下达工作任务和工作目标，同时预算也就随同一起下达，这样就可以变事后控制为事前控制和事中控制。
综上所述，医院实施MES系统软件有着明显的好处，通过科学的管理方式和先进的管理理念，对于企业的发展来说有着重要的推动作用，虽然只介绍了财务和成本的问题，但并不影响对于其提高了工作效率和面对同行业的竞争，存在着独到的作用和意义的了解。因此不管是对于医院还是其他的企业，一切都是以发展为目标的，对于有利于发展的手段和方式就在充分的准备前提下去实践和探索的。
