Stage过多导致的内存溢出

问题描述:

负荷清洗项目时,按天加载运行。运行40多天没有问题,当运行天数更多的时候,开始出现

Exception in thread "dispatcher-event-loop-31"
java.lang.OutOfMemoryError: GC overhead limit exceeded

同时,jconsole中堆内存监控呈现逐渐上升的趋势

经过一段时间后,堆内存占用率、PS Eden Space、PS Old gen接近100%。

排查过程:

1.内存溢出跟Old gen资源无法释放有关。
2.使用top命令查找当前程序运行的PID
[root@dw212 ~]# top

找到CPU占比最高且用户是root(启动脚本使用的用户名)的进程PID

3.使用jmap将内存对象信息dump下来
[root@dw212 cdTest]# jmap -dump:format=b,file=文件名.hprof PID
例如此处为:
[root@dw212 cdTest]# jmap -dump:format=b,file=jmap1.hprof 20139
Dumping heap to /home/cdTest/jmap.hprof ...
Heap dump file created

命令结束后会在执行该命令的目录下生成jmap1.hprof文件,将文件保存到本地

4.使用JProfiler工具打开该文件

可以看到不同的class所占用内存的实例个数和字节数
此处看到排除基本数据类型后HashMap、colon等class数量异常多。
点击Biggest Objects

发现org.apache.spark.ui.jobs.JobProgressListener异常大


点开后发现是一个名为stageIdToData的变量占据了大量内存

5.代码跟踪

打开org.apache.spark.ui.jobs.JobProgressListener的源代码

微信截图_20171023192818.png

不仅发现大量HashMap变量,并且看到了stageIdToData变量名
查找该变量数据清除的方法


继续跟踪retainedStages变量的初始值


发现该初始值为1000
回到Spark Master的Web管理界面找到OOM的任务,发现系统发生OOM的时候Job数量在200+,stage数量在400+,都未达到系统设定的1000,因此该部分数据一直存在内存中,占用了大量old gen空间。

6.修复

在启动脚本中加入两个参数,手动设置job和stage的释放阈值

  --conf spark.ui.retainedJobs=16 
  --conf spark.ui.retainedStages=64 

其中的16和64是计算得到的,计算过程如下

  1. 将需要循环的任务循环次数设定为1,运行程序。
  2. 在Spark Master的Web界面中统计程序运行1次时所产生的Job和Stage的数量。
  3. 将所得的数量乘以5(经验值,可随意)配置成为参数。
7.修复结果
Old Gen
8.总结

Spark程序在运行时会在Web端缓存历史的Stage和Job的状态,其中有大量的数据,如果集群的JVM内存空间有限,就需要格外注意这类的OOM。解决思路有三个。

  1. 优化代码,合并冗余的Job和Stage。
  2. 提高JVM的内存大小。
  3. 修改spark.ui.retainedJobs及spark.ui.retainedStages的大小。修改这两个参数时一定要注意,不要过小,当小到一次循环(一次大计算量)都无法完成时,会出现任务起初加载的资源在还未用完时就被释放了。
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