准备工作
- 安装bzip
- conda是linux系统的app store
安装miniconda
mkdir biosoft
cd biosoft
wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
- 添加镜像
使用miniconda
- 查看、搜索
conda list
conda search NAME
- 安装、卸载
conda install NAME -y
conda remove NAME -y
conda环境
- 查看环境
conda info --envs
- 新建环境
建立一个名叫rnaseq的conda环境,然后指定python版本是3,安装软件fastqc、trimmomatic:
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
- 激活与退出
conda activate rna-seq
conda deactivate
回到base环境