在发育关键期，双眼输入视觉信号不等会影响非弱视眼的发育。大量研究表明，弱视儿童非弱视眼的视觉功能不正常。虽然非弱视眼视力正常，但弱视眼和非弱视眼的对比敏感度均有所下降。
弱视儿童非弱视眼也表现出不同的视觉信息加工过程，因此，弱视儿童的非弱视眼是不正常的。弱视眼和非弱视眼的视觉判断反应时间均延迟。
双目视觉输入的缺失会影响与大脑下游区域（如顶叶和额叶皮层）皮质连接的发育。通常情况下，双眼总和有助于提高视觉系统的信噪比，是视觉系统成熟的关键因素。
在弱视眼中，视觉皮层和额叶皮质之间的功能联系可能会因为在发育关键时期不使用而退化。此外，在非弱视眼中，由于缺乏完全双目输入和视觉系统的低信噪比，这些连接也会减少。在CP过程中，纹状体皮质与外侧皮质的联系减少，可能会导致更高级视觉处理的异常发展，如双眼注视和双眼视觉注意。
在成人弱视患者中，非弱视眼的视觉功能也会受到影响，尽管程度比弱视眼小。研究发现成人弱视患者的整体运动加工在弱视眼和非弱视眼中均存在异常。
弱视眼和非弱视眼的整体方位辨别能力和模糊辨别能力均下降。非弱视眼的缺陷可能是由于视觉通路功能受损，该通路中大多数神经元是双眼的（例如外侧皮质），或在背侧通路中受损。外侧皮质视觉系统中这种不平衡的相互作用会降低信噪比，破坏背侧通路的空间处理和运动加工功能。
斜视患者异常的眼球运动技能会在生命早期影响大脑相关功能区的发育以及皮层下和皮层系统之间的联系。
因此，双目和单眼视觉注意功能的发展都受到干扰。此外，斜视眼的受损更严重，无法驱动成熟的眼球运动或执行熟练的视觉注意功能，从而导致视觉感知异常，临床上可诊断为儿童和成年期视力丧失和斜视性弱视。重要的是，弱视患者的非弱视眼发育和视觉功能也会受到损害。
