前言
MaxQuant免费不开源,相对其他各大厂商垄断的软件来说,实在是良心软件,尤其对labelfree数据准确性和蛋白鉴定数都有较好的优势。缺点也是很明显,Linux不友好。虽然官方也发文支持Linux系统MaxQuant goes Linux,但普遍认为体验感不好。
官方关于这方面的文档很少,只是寥寥数语描述几句:
- Install Mono Framework 5.4.1 or higher
- Edit mqpar.xml file
- run MaxQuant
有个小哥看不下去,更为详细的介绍了一下:MaxQuant in Linux,可参考他的仓库:https://github.com/blahoink/maxquant_linux_guide
安装
mono源码安装:
http://download.mono-project.com/sources/mono
MaxQuant安装:
下载解压即可。
试运行
/path/to/bin/mono /path/to/MaxQuant/bin/MaxQuantCmd.exe mqpar.xml
先占坑,后补充......