1. 转录组数据统计推断的难题 在RNA-seq中进行两组间的差异分析是最正常不过的了。 我们在其它实验中同样会遇到类似的分析，通常，我们可以用方差分析判定两组“分布”数据间...
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RNA-seq中的那些统计学问题（一）为什么是负二项分布？ -
北京基因组所研究生<br><br>Focus on Bioinformatics and Machine-Learning<br><br>Follow me on Github: <a href="https://github.com/Ming-Lian" rel="nofollow" target="_blank">https://github.com/Ming-Lian</a><br><br>跳出局部最优，搜索全局最优
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R包goseq的GO富集分析（有参情形）
前面已经讲述了R包clusterProfiler的GO富集分析[https://www.jianshu.com/p/51af63922e26]方法，本篇继续演示R包goseq...
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使用clusterProfiler进行GO、KEGG富集分析（有参情况）寻找差异表达的基因并识别它们的功能，是我们进行RNA测序的最主要目的。很明显，这些差异的基因必然与功能改变密切相关，例如，比较患病个体与正常个体的组织表达谱，不难想到这些显著...
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GEO，TCGA数据挖掘（连载中）
一，对GEO的简单介绍，下载数据 个人认为，对GEO那些复杂的介绍，我是根本记不住。所以我挑选了一些必须用到，容易记住和理解的知识给大家。 一：首先是对GSE，GSM , 和...
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GO，KEGG，GSEA富集分析笔记
what is Gene Ontology ?——基因本体论 1 ， 什么是本体论？简单来说，就是我们对一个具体事物进行分类并予以描述。例如：猫是一种哺乳动物/猫是猫科动物/...
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2021-07-01 GO、kegg富集分析What：什么是GO和KEGG？ GO全称是Gene Ontology，它分为：细胞组分（cellular component, CC）、分子功能（molecular fun...
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从0开始，包括软件安装，环境设置，原始数据下载，转换，差异基因分析等整个流程
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