IP属地:四川
您好,刚刚学习使用GenomicsDBImport,感谢您分享的内容,对我很有帮助!能请问您的interval的chr1,里面的内容是该染色体靶向的多个区间吗?还是连续的整个染色体区间呢?我把我的靶向bed文件按照染色体分开了,但是每个染色体里面还是有很多(超过100个)的小区间,参考了您的代码“-L chr1 -L chr2 …… -L chrY”,还是会提示“more than 100 intervals”,这样运行的时间还是很长,还是失败了,说tmp空间不足,某个json文件失败
GATK 4.1.4.0 CreateSomaticPanelOfNormals最近在做blood tumor paired外显子分析流程,看了一下GATK的论坛,在关于用对照样本作过滤的问题上,曾经的设置质量参数作硬性过滤条件的方法已经out,现在GA...