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    一文讲完叶绿体基因组比较分析的全部软件和配套ggplot绘图脚本

    前段时间,发表了一篇叶绿体基因组比较分析文章。尽管这类套路文已经不再热门,但在准备数据分析的过程中,仍感各种资料教程之零散,各种文章的做图工具也...

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    叶绿体基因组的GetOrganelle组装、批量任务和结果合并

    1 叶绿体的组装 1.1 GetOrganelle的安装 此处默认Anaconda已经安装,那么使用下面的命令即可安装GetOrganelle:...

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    系统发育树构建简明教程

    1. 前言 构建一棵系统发育树是研究系统学和进化的基础。然而,发育树的构建是对分类单元进化历史的推测,因此对发育树的可靠性检验也是重中之重。一棵...

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    小地理范围的采集示意图制作方法

    近期,由于个人文章需要在小地理范围地形图上标注采样点,即一个精准位置标注的采样示意图。之前在中国地图上直接手动粗糙地标注采集点的方法已经难以满足...

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    遗传聚类软件BAPS教程

    介绍使用BAPS推断群体遗传结构的具体方法。BAPS与STRUCTURE类似,都是基于哈温平衡假设和贝叶斯推断来估算个体的遗传聚类(K)归属。该...

  • 系统发育常见软件与在线工具合集

    本篇文章是为了记录本人在系统发育实验和数据分析过程中,所使用过的以及部分未使用但如雷贯耳的软件的集合。当然,相对于整个系统发育软件之汪洋大海,此...

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  • Consel教程

    介绍Consel系统发育检测软件的使用教程。 1. 简介 系统发育是一种历史过程,任何基于分子数据集得到的发育树都是对真实系统发生的推测。一个合...