一些生物信息学用到的软件，工具，介绍用法安装以及以及应用的文章 🛠 测序组装使用的Spades、canu等等 🛠 序列比对比如blast、bowtie、diamond等 🛠 多序列比对比如mega、clustalW、matff等 🛠 序列格式转化的samtools、bedtools等等 🛠 可变剪接分析的rMATS、MISO 🛠 微卫星序列查找工具misa等 🛠 call peak的工具macs2 🛠 文献下载工具Sci-hub桌面版 🛠 进化树构建工具IQtree、ggtree等 🛠 同源基因查找工具OrthoMCL、OrthoFinder等 🛠 寻找测序中的结构变异或者SNP序列GATK、bcftools等 🛠 宏基因组组装与分析的anvi'o、QIMME 🛠 测序质量评估的FastQC、BUSCO、QUAST 🛠 可视化工具比如IGV、3D Genome 🛠 测序数据下载工具SRA Toolkit、ascp等 🛠 数据可视化的工具circos 等等

终身学习者、大学教师。稍微懂一点儿写作、演讲、Python和机器学习。欢迎微信关注并置顶我的公众号“玉树芝兰”(nkwangshuyi)。我已委托“维权骑士”（rightknights.com）为我的文章进行维权行动。

《基因的生物信息学分析》借助高通量测序和生物信息学分析，解码生物基因组，揭示生命奥秘。

常居中国南方的 化学生物狗一只，现在溜去CUHK读博去了，从事生物信息的工作。常用语言 python、R、javascript，熟练使用python的工程师一枚。