前言：从今天开始就开始为拼装转录组做准备啦，今天听了技能树组织的生信人论坛，感觉很有意思。特此声明：本文所有代码及文件经通过本人亲自实践！绝对没有副作用！当然希望大家多提出宝...
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一文读懂FastQC Report -
那说明到时候心态更好了，加油
没有理想的人不伤心
按照惯例每年生日都会写一篇文，但是今年6月的时候没有太多的想法，所以就搁置了，时隔2个月，终于有了起笔的想法。 看了看上一年的日志，我想在去年写日志之时，无论如何都不会想到今...
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把基因画在染色体上之前有一次，我导说“能不能把这些基因按顺序画在果蝇的染色体上”，因此，我寻找了一些实现这个需求的方法。经过一番奇奇怪怪的操作之后，最终用ggplot2画了。。。其它方法简单地...
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突然的顿悟吧
今天听完师兄的工作汇报，突然发现自己一直以来学习方法的一个弊端，总是在接触一个新东西的时候想到的第一件事情是去谷歌，而不是去从读文献入手。其实很多时候我们所谓的分析方法都...
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R语言怎么更好的进行可视化（持续更新）推荐相关学习资料 一、 MPA 635: DATA VISUALIZATION，里面有如下几大板块。每一块都干货十足 Citations and bibliography I...
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RNAseq下游分析--edgeR +cluserprofiler
RNAseq分析可以用hisat2+samtools+stringtie得到表达矩阵，后面可以通过edgeR + clusterprofiler分析。 Mut_Wt为stri...
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hisat2+stringtie+deseq2 RNAseq（二）测序得到的是几百bp的短read， 相当于把拼图打散了给你。如果没有参考基因组，从头组装会有很大的工作量，而且对于有参考基因组的动植物来说，不依靠参考基因组进行RNAseq ...
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Perian是不是不能用了？我安装之后没反应，还是不能播放FLV
Mac系统下倍速播放器-Quicktime player 的使用方法
1.播放器以 1.1、1.2 倍速等更精确速度快进/快退播放的方法 答：苹果的 QuickTime Player 播放器上点击双箭头按钮可以用 2、4、8 倍的速度快进/快退...
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还在用Word写论文？看看这款专业写作工具
好马配好鞍，你还在用word或wps写稿吗？论文写作思路很重要，但不得不承认好的写作工具也很重要。它不仅能帮你提高写作效率，还可能带来意想不到的灵感！ 小编以前在用word做...
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学习雷锋好榜样
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四大工具帮你在Mac上搞学术对于一个长期进行学术研究的人，使用Mac搞学术一定遇到诸多难题，包括： 缺乏像winedt那样直接方便的latex编辑器。虽然Sublime和Vim可以解决你的问题，但是除了...
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
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结合CHIP-seq和ATAC-seq结果进行分析上一篇文章里讲到了如何进行ATAC-seq的简单分析（ATAC-seq分析练习）。在文献中（Cell Stem Cell 2017 Nov 2;21(5):650-664.e...
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基因组的从头组装基因组组装一般分为三个层次，contig, scaffold和chromosomes. contig表示从大规模测序得到的短读(reads)中找到的一致性序列。组装的第一步就...
