请问这个问题解决了吗
在R中利用fasta序列构建进化树“进化树的构建怎么操作？”“那肯定是用MEGA啊！” 可是真的好麻烦啊，要先比对再建树，然后再进行各种美化，习惯了R就用R解决吧。 简单Google之后发现R有现成的包可以完...
发简信
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生信 | 构建物种的OrgDb写在前面 本文主要参考生信小白2018[https://www.jianshu.com/p/bb4281e6604e]与多啦A梦的时光机[https://www.jiansh...
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@kkkkkkang LOC1077……是基因id，但query是蛋白id啊
非模式生物本生烟草 (Nicotiana benthamiana) GO/KEGG富集分析 | 转录组
AnnotationHub中没有本生烟草数据库，只好自己构建，再利用Y叔的clusterProfiler包做富集分析了。首先参考非模式生物富集分析[https://mp.we...
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您好，我想问一下您用的这个本生烟草蛋白序列的蛋白标识符并不能找到对应的gene id，您是怎么处理的？这个建库所用的eggnog输出的query_name是Niben101Scf03816g02010.1等这些，但是我的需要分析的差异基因的gene id是LOC1077……之类的，然后我想把蛋白id转化为gene id，但我发现Niben101Scf03816g02010.1在NCBI上无法查到，且用uniprot也无法找到，因此无法转换，请问您是怎么做的呢？非常期待能得到您的指点！
非模式生物本生烟草 (Nicotiana benthamiana) GO/KEGG富集分析 | 转录组
AnnotationHub中没有本生烟草数据库，只好自己构建，再利用Y叔的clusterProfiler包做富集分析了。首先参考非模式生物富集分析[https://mp.we...
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我要偷偷内卷，然后惊艳所有人！
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成功！太感谢了！
生信 | 构建物种的OrgDb
写在前面 本文主要参考生信小白2018[https://www.jianshu.com/p/bb4281e6604e]与多啦A梦的时光机[https://www.jiansh...
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求代码！🙏
生信 | 构建物种的OrgDb
写在前面 本文主要参考生信小白2018[https://www.jianshu.com/p/bb4281e6604e]与多啦A梦的时光机[https://www.jiansh...
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您好，可以分享一下烟草注释数据库的建库方法吗，我在建烟草数据库的时候遇到很多困难，太难了😭
非模式生物本生烟草 (Nicotiana benthamiana) GO/KEGG富集分析 | 转录组
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